如何在python中创建堆积线图？

Question

在300个独立细胞的200个时间步长内，我具有荧光值。我想将它们全部绘制在同一图上，一图叠加。我不想绘制堆积面积图。下图是我要寻找的图像，但实际上是每个单元格的数据绘制在其自己的y轴上，所有单元格都具有相同的x轴。

Answer 1

在python中，主要的绘图工具（可与熊猫配合使用）是matplotlib（较旧）和seaborn（较新和较新的版本）。

查看seaborn的文档（https://seaborn.pydata.org/tutorial/axis_grids.html）和食谱页面（https://python-graph-gallery.com/122-multiple-lines-chart/） 对于多组分合成图，您可以显示荧光数据，如下所示：

# libraries
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
import pandas as pd

# Data
df=pd.DataFrame({'x': range(100), 
                 'trace1': np.random.randn(100), 
                 'trace2': np.random.randn(100)+10, 
                 'trace3': np.random.randn(100)+20})

# multiple line plot
plt.plot( 'x', 'trace1', data=df, marker='', color='black', linewidth=2)
plt.plot( 'x', 'trace2', data=df, marker='', color='black', linewidth=2)
plt.plot( 'x', 'trace3', data=df, marker='', color='black', linewidth=2, label="GluK1c")
plt.legend()

我不喜欢这种 hack （向每个跟踪y值添加数字），因为应该有一种方法可以使您的y轴值偏移在matplotlib中，但在谷歌搜索时找不到该选项。

在这种情况下，因为您需要极简的黑线痕迹（神经科学期刊所期望的），所以matplotlib和seaborn可以媲美。

有关过多的图例位置/格式选项，请参见https://matplotlib.org/3.1.1/api/_as_gen/matplotlib.pyplot.legend.html

我希望我在实验室工作时拥有这些工具。会比我那时做的好得多。

Answer 2

您可以这样做，例如：

your_df.plot(subplots=True, layout=(10,30));