我正在进行森林恢复,我想测试3种处理对物种组成的影响。
总结我的数据:我有18个站点中的34种维管束植物的存在/不存在和丰度数据(ID
)。在这些站点中,应用了3种不同的处理方法(每个Treatment
中有6个站点),并且在应用Timeline
之前,之后和之后8年收集了数据,因此我还采取了重复措施。
在对adonis2()
执行permanova测试之前,我对数据进行了平方根变换,然后使用vegdist()
的方法bray
(FL.dist
)创建了距离矩阵。
测试并满足了各组之间分散均匀性的假设。要执行permanova,我使用了以下代码:
FL.div<-adonis2(FL.dist~Treatment+Timeline, data=Permanova_fieldlayer,
permutations = 999,method="bray", strata="ID")
我的问题是,我是否将Timeline
视为另一个固定因素效应?如何指定该变量应用作重复测量?