在heatmap.2中更改树状图的线宽

Question

我正在尝试使用gplots::heatmap.2()绘制热图。有很多行，树状图线与图像相比显得很细。我想知道是否有任何技术可以使pheatmap输出中的this post中提到的树状图线变粗。 谢谢

Answer 1

是的，dendextend软件包很容易做到这一点。我们可以在这里使用其set()函数来达到预期的效果。

set.seed(123)
dat <- matrix(rnorm(100), nrow = 10)

library(gplots)
library(dendextend)

dd <- set(as.dendrogram(hclust(dist(dat))), "branches_lwd", 3)

heatmap.2(dat, Rowv = dd, Colv = dd)

值得研究Dendextend的所有其他出色功能。