Question

我目前正在尝试对某些数据运行varpart函数，但是每次都会收到以下错误消息： “ qr.default（X，tol = 1e-06）中的错误：外部函数调用中的NA / NaN / Inf（arg 1）“

简而言之，我的整个数据集包含有关渔具，压力水平和不同时间段的信息。我对所有数据都运行varpart函数没有问题，但是如果我仅使用有关特定齿轮和/或特定压力的数据创建一个新对象，它将不再起作用。...

我检查了缺失值，但找不到一个...

这是我的问题的一个例子：

library(vegan)
#> Le chargement a nécessité le package : permute
#> Le chargement a nécessité le package : lattice
#> This is vegan 2.5-5
A<-runif(45,min=0,max=0.75)
B<-runif(45,min=0,max=0.75)
C<-runif(45,min=0,max=0.75)
SP<-data.frame(cbind(A,B,C))
Session<-as.factor(rep(c("S1","S2","S3","S4","S5"),each=9))
LONG<-rep(c(48.32287917),each=45)
data<-data.frame(cbind(Session,LONG))
data$Session<-as.factor(data$Session)
varpart<-varpart(SP,~ Session,~ LONG, data=data)
#> Error in qr.default(X, tol = 1e-06) : 
  NA/NaN/Inf in foreign function call (arg 1)

你们中的任何人是否曾经遇到过此类问题，或者知道如何解决？谢谢！

Answer 1

varpart执行变体分区，为此，它至少需要两个变量才能对变体进行分区。您只有一个（Session）–您提供的第二个（LONG）是常量，因此可以解释否的变化，并且不算作变量。我们不会检查不变的“变量”，并且您会收到令人困惑的错误消息。但是，如果您使用无意义的（常量）“变量”手工制作模型，则应该收到奇怪的错误消息。我们可以添加一个针对常量的测试，但是以某种方式感到奇怪。

如何运行vegan :: varpart而不出现此“外部函数调用中的NA / NaN / Inf（arg 1）”消息错误？

1 个答案: