从4d NetCDF文件中仅提取底部温度

时间:2019-08-16 18:52:21

标签: r raster netcdf nco cdo-climate

我有一个关于海洋温度的NetCDF文件。它具有1个变量(“温度”)和4个维度(时间,经度,纬度和深度)。我只想提取每个时间,经度和纬度的最大深度的温度,以获得底海温度栅格砖。我愿意使用R或在终端中使用Climate Data Operators。

NetCDF文件的属性

nc_open('data.pre1980.nc')
File data.pre1980.nc (NC_FORMAT_CLASSIC):

     1 variables (excluding dimension variables):
        float temp[lon,lat,depth,time]   
            standard_name: sea_water_temperature
            long_name: TEMPERATURE
            units: Celsius_scale
            _FillValue: -9.98999971057742e+33
            missing_value: -9.98999971057742e+33
            pointwidth: 1

     4 dimensions:
        time  Size:324   *** is unlimited ***
            standard_name: time
            units: months since 1960-01-01
            calendar: 360_day
            axis: T
        lon  Size:440
            standard_name: longitude
            long_name: longitude
            units: degree_east
            axis: X
        lat  Size:179
            standard_name: latitude
            long_name: latitude
            units: degree_north
            axis: Y
        depth  Size:40
            units: meters
            axis: Z
            gridtype: 0

    4 global attributes:
        CDI: Climate Data Interface version 1.9.6 (http://mpimet.mpg.de/cdi)
        Conventions: CF-1.6
        history: Fri Aug 16 13:33:42 2019: cdo merge data.nc data.nc.1 data.nc.2 data.nc.3 data.nc.4 data.nc.5 data.pre1980.nc
        CDO: Climate Data Operators version 1.9.6 (http://mpimet.mpg.de/cdo)

谢谢!

2 个答案:

答案 0 :(得分:2)

尝试使用负数ncks的NCO的hyperslab

ncks -d depth,-1 in.nc out.nc

不可能有一个更简洁的解决方案。

答案 1 :(得分:0)

CDO确实具有相同的功能,带有负索引以表示从文件末尾开始反向计数(时间,高度等...),因此您也可以这样做:

cdo sellevidx,-1 in.nc out.nc

但是查理是对的,nco更为简洁,因为它需要输入比cdo少的字符,除非您当然要使用垂直坐标名称长于“ depth”的文件来进行此操作,在这种情况下cdo胜出;-)