我通过将Github目录克隆到我的HOME文件夹中来安装PHASTER。但是,键入命令后
phaster.py --contigs --fasta path/to/genome.fasta
我读到这个错误
2019-07-11 14:32:02,389 INFO:TH19.fna的提交出现 成功
2019-07-11 14:32:02,390信息:job_id:ZZ_0f276b0c53
2019-07-11 14:32:02,390信息:错误:序列头未打开 第一行。请检查!
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文件
中的文件“ /home/fox/phaster_scripts/phaster.py”,第162行job_id, status, date = submit_job(fasta, options.url, {"contigs": int(options.contigs)})
文件“ /home/fox/phaster_scripts/phaster.py”,第99行,在Submit_job中 返回r_dict [“ job_id”],r_dict [“ status”],datetime.datetime.now()
KeyError:'状态'
有人知道如何解决这个问题吗?