Question

我正在尝试提供一个已经设置的项目及其依赖库。

都使用miniconda定义库。

这是一个初始脚本：

#!/bin/bash

project_home_path=`dirname $( cd "$(dirname "$0")" ; pwd -P )`
source /home/${USER}/miniconda/etc/profile.d/conda.sh
conda env create -f ${project_home_path}/environment.yml > /dev/null 2>&1
conda activate <env-name>
/home/${USER}/miniconda/bin/app.py & echo $! > /tmp/env-name.pid

这行不通，因为conda activate <env-name>行未能激活并无法提供所需的库。

在阅读了文档[1]之后，该脚本已被充实。

#!/bin/bash

project_home_path=/home/${USER}/folder
source /home/${USER}/miniconda/etc/profile.d/conda.sh
conda env create --force -f ${project_home_path}/project/environment.yml  > /dev/null 2>&1
conda env create --force -f ${project_home_path}/library/environment.yml > /dev/null 2>&1
conda env export -n <project-env> > /tmp/env.yml
conda env update -n base -f /tmp/env.yml > /dev/null 2>&1
conda env export -n <library-env> > /tmp/env.yml
conda env update -n base -f /tmp/env.yml > /dev/null 2>&1
cd /home/${USER}/folder/library && python setup.py install
cd /home/${USER}/folder/project && python setup.py install

这确实执行了生产和工作所需的聚合，但是我想知道如何更好地进行聚合。

[1] https://docs.conda.io/projects/conda/en/latest/user-guide/tasks/manage-environments.html

Answer 1

创建一个一个环境，其中包含您需要的所有库和软件包。
conda env export -n MyOneEnvironment -f everything.yml

然后进行配置：

conda env create -n TheNewEnvironment -f everything.yml
conda activate TheNewEnvironment
安装不是conda软件包的所需内容

设置后，每次要在该环境中运行程序时，都需要重复conda activate命令。

在第二个脚本示例中，您将从yml文件创建两个环境，只是要重新导出已安装软件包的列表，然后将它们安装到基本环境中。因此，您一共有三种环境。

如果需要将东西安装到conda基本环境中，请收集一个everything.yml文件，其中包含所有需要的内容，然后使用conda env update -n base --file everything.yml。
但是，以这种方式污染基础环境是一个坏主意。如果您需要安装项目或程序的先决条件，则应为此创建一个专用的conda环境，并不要理会基础环境。然后，您可以将任意数量的项目和程序安装到单独的环境中，而不会干扰彼此。

如何聚合conda环境？

1 个答案: