在Rmarkdown中打印可读的因子分析输出

时间:2019-06-07 14:42:59

标签: r r-markdown psych

我必须在Rmarkdown文档(最终可以是pdf,word或html)中打印可读性因子分析输出,而这样做确实有麻烦。我遇到了这个问题here。我正在运行心理版本1.8.12。

下面是可复制的代码,但是我还在这里建立了一个github仓库:

请注意,当我运行results='markup'时,pdf会编译,但该表不可读:它将打印乳胶代码。当我运行results='asis'时,返回错误! LaTeX Error: \caption outside float.

我对kabel和texreg等软件包不太熟悉。这些可以选择吗? `


title: "Factor Analysis Test"
author: "Simon Kiss"
date: '2019-06-07'
output: pdf_document
---

```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
```

```{r}
library(psych)
```

```{r}
data('Thurstone')
```
```{r}
mod<-fa(Thurstone, 3)
```
```{r results='markup'} 
fa2latex(mod)
````

3 个答案:

答案 0 :(得分:1)

错误在fa2latex输出中。由于某些奇怪的原因,它将scriptsize更改为s\iptsize。 以下更改修复了输出:

```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
```

```{r}
library(psych)
```


```{r}
data('Thurstone')
```
```{r}
mod<-fa(Thurstone, 3)
```
```{r, results='asis'} 
a <- fa2latex(mod, silent = T)
cat(gsub('s\\iptsize','scriptsize',a))
```

编辑

该错误只是停止了,对我而言是可复制的,不确定是怎么回事。 突然

```{r, results='asis'} 
a <- fa2latex(mod, silent = F)
```

确实能够正常工作

答案 1 :(得分:0)

如果要输出表,请确保先将其转换为数据框。

title: "Factor Analysis Test"
author: "Simon Kiss"
date: '2019-06-07'
output: pdf_document
---

```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
```

```{r}
library(psych)
```

```{r}
data('Thurstone')
```

```{r}
mod<-fa(Thurstone, 3)
```
```{r results='markup'} 
knitr::kable(data.frame(psych::fa.sort(mod$loadings)[1:8,]))

答案 2 :(得分:0)

在这种情况下,您需要将fa2latex(mod)的输出直接添加到文档中,而不要添加到{r results='markup'}内,然后生成pdf而不是html或doc。将下面的代码复制并粘贴到Rmd文档中,看看会发生什么。

---
output:
  pdf_document: default
  html_document: default
  word_document: default
---
title: "Factor Analysis Test"
author: "Simon Kiss"
date: '2019-06-07'
output: pdf_document
---

```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
```

```{r}
library(psych)
```

```{r}
data('Thurstone')
```

```{r}
mod<-fa(Thurstone, 3)
```

% Called in the psych package  fa2latex % Called in the psych package  mod 
\begin{table}[htpb]\caption{fa2latex}
\begin{center}
\begin{scriptsize} 
\begin{tabular} {l r r r r r r }
 \multicolumn{ 6 }{l}{ A factor analysis table from the psych package in R } \cr 
 \hline Variable  &   MR1  &  MR2  &  MR3  &  h2  &  u2  &  com \cr 
  \hline 
Sentences   &  \bf{ 0.90}  &  -0.03  &   0.04  &  0.82  &  0.18  &  1.01 \cr 
 Vocabulary   &  \bf{ 0.89}  &   0.06  &  -0.03  &  0.84  &  0.16  &  1.01 \cr 
 Sent.Completion   &  \bf{ 0.84}  &   0.03  &   0.00  &  0.74  &  0.26  &  1.00 \cr 
 First.Letters   &   0.00  &  \bf{ 0.85}  &   0.00  &  0.73  &  0.27  &  1.00 \cr 
 Four.Letter.Words   &  -0.02  &  \bf{ 0.75}  &   0.10  &  0.63  &  0.37  &  1.04 \cr 
 Suffixes   &   0.18  &  \bf{ 0.63}  &  -0.08  &  0.50  &  0.50  &  1.20 \cr 
 Letter.Series   &   0.03  &  -0.01  &  \bf{ 0.84}  &  0.73  &  0.27  &  1.00 \cr 
 Pedigrees   &  \bf{ 0.38}  &  -0.05  &  \bf{ 0.46}  &  0.51  &  0.49  &  1.96 \cr 
 Letter.Group   &  -0.06  &   0.21  &  \bf{ 0.63}  &  0.52  &  0.48  &  1.25 \cr 
\hline \cr SS loadings & 2.65 &  1.87 &  1.49 &  \cr  
\cr 
            \hline \cr 
MR1   & 1.00 & 0.59 & 0.53 \cr 
 MR2   & 0.59 & 1.00 & 0.52 \cr 
 MR3   & 0.53 & 0.52 & 1.00 \cr 
 \hline 
\end{tabular}
\end{scriptsize}
\end{center}
\label{default}
\end{table}