我正在尝试使用具有purrr映射的Modelr中的permute函数来计算置换下两类数据的平均值。
如果我要根据排列的数据集计算线性模型,则该函数的行为将与预期的一样,根据modelr :: permute的示例文件(尽管我正在自定义函数中运行线性模型):
library(tidyverse)
library(modelr)
perms <- permute(mtcars, 1000, mpg)
jlm <- function(df){lm(mpg ~ wt, data = df)}
models3 <- map(perms$perm, jlm)
models3[[1]]
Call: lm(formula = mpg ~ wt, data = df) Coefficients: (Intercept) wt 28.211 -2.524
现在,我不是线性模型,而是想要该数据集中两个类别的平均值。我尝试运行如下。
mean_of_vs <- function(df){ df %>% group_by(vs) %>% summarize(mean(mpg)) %>% spread(vs, `mean(mpg)`) %>% rename(zero = `0`, one = `1`) } models4 <- map(perms$perm, ~mean_of_vs) models4[[1]]
但这只是返回函数方程,而不是函数的输出
function(df){ df %>% group_by(vs) %>% summarize(mean(mpg)) %>% spread(vs, `mean(mpg)`) %>% rename(zero = `0`, one = `1`) }
等式本身在一个简单的数据帧上起作用。
test <- perms %>% pull(perm) %>% .[[1]] %>% as.data.frame
mean_of_vs(test)
# A tibble: 1 x 2 zero one <dbl> <dbl> 1 16.6 24.5
所以我的问题是,为什么我的自定义函数不返回一堆平均值为vs = 0和vs = 1的单行数据帧,我将如何获得它呢?
谢谢。
答案 0 :(得分:1)
置换返回类型<S3: permutation>
,不是一个数据帧。
> perms
# A tibble: 1,000 x 2
perm .id
<list> <chr>
1 <S3: permutation> 0001
2 <S3: permutation> 0002
3 <S3: permutation> 0003
4 <S3: permutation> 0004
5 <S3: permutation> 0005
6 <S3: permutation> 0006
7 <S3: permutation> 0007
8 <S3: permutation> 0008
9 <S3: permutation> 0009
10 <S3: permutation> 0010
# ... with 990 more rows
检查它会发现数据帧存储为命名列表中的第一个元素:
> glimpse(perms[[1,1]])
List of 3
$ data :'data.frame': 32 obs. of 11 variables:
..$ mpg : num [1:32] 21 21 22.8 21.4 18.7 18.1 14.3 24.4 22.8 19.2 ...
..$ cyl : num [1:32] 6 6 4 6 8 6 8 4 4 6 ...
..$ disp: num [1:32] 160 160 108 258 360 ...
..$ hp : num [1:32] 110 110 93 110 175 105 245 62 95 123 ...
..$ drat: num [1:32] 3.9 3.9 3.85 3.08 3.15 2.76 3.21 3.69 3.92 3.92 ...
..$ wt : num [1:32] 2.62 2.88 2.32 3.21 3.44 ...
..$ qsec: num [1:32] 16.5 17 18.6 19.4 17 ...
..$ vs : num [1:32] 0 0 1 1 0 1 0 1 1 1 ...
..$ am : num [1:32] 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 ...
..$ gear: num [1:32] 4 4 4 3 3 3 3 4 4 4 ...
..$ carb: num [1:32] 4 4 1 1 2 1 4 2 2 4 ...
$ columns: Named chr "mpg"
..- attr(*, "names")= chr "mpg"
$ idx : int [1:32] 1 30 21 12 27 14 17 2 15 32 ...
- attr(*, "class")= chr "permutation"
要执行所需的操作,只需在data
函数的第一步中访问mean_of_vs()
元素:
mean_of_vs <- function(df) {
df$data %>%
group_by(vs) %>%
summarize(mean(mpg)) %>%
spread(vs, `mean(mpg)`) %>%
rename(zero = `0`, one = `1`)
}
现在一切正常:
> models4 <- map(perms$perm, mean_of_vs)
> models4[[1]]
# A tibble: 1 x 2
zero one
<dbl> <dbl>
1 16.6 24.6
答案 1 :(得分:1)
很高兴见到你。
modelr::permute
产生其类别为“置换”的数据
> class(perms[[1]][1][[1]])
[1] "permutation"
permutation
类具有3个属性
此变量中的数据
您要置换的列
指示已选择哪些行的索引
我认为permutation
仅采用某些公式(例如lm
和etc
。我不确定公式列表)。
因此,如果要使用功能,则必须转换为data.frame / data.table / tibble,如下所示
mean_of_vs <- function(df){
df %>%as.data.frame() %>% group_by(vs) %>% summarize(mean(mpg)) %>% spread(vs, `mean(mpg)`) %>%
rename(zero = `0`, one = `1`)
}
然后,以map
表示法执行~
函数。
models4 <- map(perms$perm, mean_of_vs)
然后您将得到结果
.....
[[97]]
# A tibble: 1 x 2
zero one
<dbl> <dbl>
1 21.4 18.4
[[98]]
# A tibble: 1 x 2
zero one
<dbl> <dbl>
1 20.4 19.7
.....