Question

我正在尝试在散点图中绘制不对称的颜色范围。我希望颜色能够使用diverging color map正确地表示强度。我在更改颜色条来表示这一点时遇到麻烦。

例如，我想在散点图中绘制范围为[-2，10]的xy数据，以便色条仅显示-2到10，中性色为0，而“强度”为- 2和2相同。

我尝试使用ColorMap Normalization和truncating the color map，但似乎我需要将我无法弄清楚的两者结合起来。

MCV示例

x = np.arange( 0, 1, 1e-1 )
xlen = x.shape[ 0 ]
z = np.random.random( xlen**2 )*12 - 2


splt = plt.scatter( 
    np.repeat( x, xlen ), 
    np.tile( x, xlen ), 
    c = z, cmap = 'seismic',
    s = 400
)

plt.colorbar( splt )

通过使用MidpointNormalize

class MidpointNormalize(colors.Normalize):
    def __init__(self, vmin=None, vmax=None, midpoint=None, clip=False):
        self.midpoint = midpoint
        colors.Normalize.__init__(self, vmin, vmax, clip)

    def __call__(self, value, clip=None):
        # I'm ignoring masked values and all kinds of edge cases to make a
        # simple example...
        x, y = [self.vmin, self.midpoint, self.vmax], [0, 0.5, 1]
        return np.ma.masked_array(np.interp(value, x, y))

x = np.arange( 0, 1, 1e-1 )
xlen = x.shape[ 0 ]
z = np.random.random( xlen**2 )*12 - 2

norm = MidpointNormalize( midpoint = 0 )

splt = plt.scatter( 
    np.repeat( x, xlen ), 
    np.tile( x, xlen ), 
    c = z, cmap = 'seismic', s = 400,
    norm = norm
)

plt.colorbar( splt )

我可以使颜色条居中于0，但是强度不公平。即-2处的强度要比+2处的强度暗得多。

截断颜色图时遇到的问题是我不知道截断颜色图的正确位置。

以下是我要在颜色栏中进行的更改的示例：

Answer 1

如果我正确理解，那么当前的问题是，以中点为中心的贴图会将颜色均匀从-2缩放到0（蓝色），类似地（红色）从0缩放到10。

您应该在[self.vmin, self.midpoint, self.vmax] = [-2, 0, 10]之间重新缩放，而不是缩放[-v_ext, self.midpoint, v_ext] = [-10, 0, 10]，其中：

v_ext = np.max( [ np.abs(self.vmin), np.abs(self.vmax) ] )  ## = np.max( [ 2, 10 ] )

完整的代码如下：

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
import matplotlib.colors as mcolors

x = np.arange( 0, 1, 1e-1 )
xlen = x.shape[ 0 ]
z = np.random.random( xlen**2 )*12 - 2

class MidpointNormalize(mcolors.Normalize):
    def __init__(self, vmin=None, vmax=None, midpoint=None, clip=False):
        self.midpoint = midpoint
        mcolors.Normalize.__init__(self, vmin, vmax, clip)

    def __call__(self, value, clip=None):
        v_ext = np.max( [ np.abs(self.vmin), np.abs(self.vmax) ] )
        x, y = [-v_ext, self.midpoint, v_ext], [0, 0.5, 1]
        return np.ma.masked_array(np.interp(value, x, y))

x = np.arange( 0, 1, 1e-1 )
xlen = x.shape[ 0 ]
z = np.random.random( xlen**2 )*12 - 2

norm = MidpointNormalize( midpoint = 0 )

splt = plt.scatter( 
    np.repeat( x, xlen ), 
    np.tile( x, xlen ), 
    c = z, cmap = 'seismic', s = 400,
    norm = norm
)

plt.colorbar( splt )
plt.show()

Answer 2

基于@Asmus的答案，我创建了一个MidpointNormalizeFair类，该类基于数据进行缩放。

class MidpointNormalizeFair(mpl.colors.Normalize):
    """ From: https://matplotlib.org/users/colormapnorms.html"""
    def __init__(self, vmin=None, vmax=None, midpoint=None, clip=False):
        self.midpoint = midpoint
        mpl.colors.Normalize.__init__(self, vmin, vmax, clip)

    def __call__(self, value, clip=None):
        # I'm ignoring masked values and all kinds of edge cases to make a
        # simple example...

        result, is_scalar = self.process_value(value)
        self.autoscale_None(result)

        vlargest = max( abs( self.vmax - self.midpoint ), abs( self.vmin - self.midpoint ) )
        x, y = [ self.midpoint - vlargest, self.midpoint, self.midpoint + vlargest], [0, 0.5, 1]
        return np.ma.masked_array(np.interp(value, x, y))

具有公平发散色图的不对称色条

2 个答案: