Question

我将9500万行9列的文件上传到了具有32 Gb内存的工作站上的MySQL数据库。它们是遗传数据，第一列是染色体编号（chr TINYINT）和基因组位置（pos BIGINT）。我正在尝试在chr和pos的MySQL Workbench 8.0中创建索引，但是索引要花几个小时才能超时。

我还尝试仅在染色体上索引（这只是从1到22的带符号TINYINT），但没有成功。像这样挂几个小时索引是否正常？ Windows任务管理器说我只使用8 Gb的内存。

Answer 1

当我使用SQL时，对我有用的一个技巧是-在上传数据之前添加索引。

在执行create table语句后，立即添加

ALTER TABLE <table_name> ADD KEY ...

然后开始上传。

如果转储中有CREATE TABLE ...条语句，请确保它也有IF NOT EXISTS并且没有DROP TABLE ...。

我不确定Windows，但是对于我作为MySQL操场服务器使用的Ubuntu，16Gb RAM足以处理50M +行表。