R-Pack素食主义者Decorana

时间:2019-02-07 07:18:28

标签: r-package vegan

enter image description here我是R的新手,我正尝试运行Detrended对应分析(DCA),这是一种用于物种排序的多变量统计分析,我有四个站点。我不断收到错误消息:

> Error rowsums x must be numeric 

Species     Haasfontein Mini Pit    Vlaklaagte Mini Pit Vlaklaagte Block 3 Mini Pit Block 10 Mini Pit
Agrostis lachnantha 1   0   0   0
Aristida congesta subsp. Congesta   0   0   0   0
Brachiaria nigropedata  0   0   0   0
Cynodon dactylon    0   12  2   3
Cyperus esculentus  0   5   0   0
Digitaria eriantha  0   1   6   20
Elionurus muticus   0   0   0   0
Eragrostis acraea De Winter 0   0   1   0
Eragrostis chloromelas  35  0   12  4
Eragrostis curvula  6   0   0   0
Eragrostis lehmanniana  5   0   0   0
Eragrostis rigidior 3   0   1   0
Eragrostis rotifer  3   0   0   0
Eragrostis trichophora  10  1   2   2
Hyparrhenia hirta   0   0   9   1
Melinis repens  0   0   2   0
Panicum coloratum   0   4   0   0
Panicum deustum     3   0   0   0
Paspalum dilatatum  0   0   0   0
Setaria sphacelata var. sphacelata  0   1   0   0
Sporobolus africanus    0   0   2   0
Sporobolus centrifuges  1   0   1   0
Sporobolus fimbriatus   0   0   0   0
Sporobolus ioclados 2   0   5   1
Themeda triandra    0   0   0   0
Trachypogon spicatus    0   0   0   0
Tragus berteronianus    0   0   0   1
Verbena bonariensis 16  0   2   0
Cirsium vulgare 0   0   0   0
Eucalyptus cameldulensis    1   0   0   0
Xanthium strumarium 0   0   0   0
Argemone ochroleuca 0   0   0   0
Solanum sisymbriifolium 0   0   0   0
Campuloclinium macrocephalum    7   0   0   0
Paspalum dilatatum  0   0   0   0
Senecio ilicifolius 0   0   0   0
Pseudognaphalium luteoalbum (L.)    8   0   0   0
 Cyperus esculentus     0   0   0   0
Foeniculum vulgare  0   0   0   0
Conyza canadensis   0   0   0   1
Tagetes minuta  0   0   0   0
Hypochaeris radicata    0   0   0   0
Solanum incanum 0   0   0   0
Asclepias fruticosa 11  0   0   0
Hypochaeris radicata    0   0   0   0

我的数据的组织方式如上所示,我不确定我的数据的组织方式是否正确或是否存在其他错误。有人可以帮助我

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

您仍在努力将数据导入 R 。那是你的第一个问题。解决此问题并设法读取数据后,您将遇到以下问题:

  1. 您的数据中不应有空(全为零)行,但它们将给出错误信息(空列将被删除,仅发出警告)。
  2. DCA非对称地对待行和列,因此应将种类作为列,将采样单位作为行。您应该转置数据(函数Long)。
  3. 您真的不应仅将DCA与四个采样单位一起使用。这将毫无意义。

我认为最后一点是最重要的。