Question

这是我的数据框（请复制并粘贴以复制）：

Control <- replicate(2, c("112", "113", "116", "118", "127", "131", "134", "135", "136", "138", "143", "148", "149", "152", "153", "155", "162", "163"))
EPD <- replicate(2, c("101", "102", "103", "104", "105", "106", "107", "108", "109", "110", "114", "115", "117", "119", "120", "122", "124", "125", "126", "128", "130", "133", "137", "139", "140", "141", "142", "144", "145", "147"))
Subject <- c(Control, EPD)
Group <- c(replicate(36, "Control"), replicate(60, "Patient"))
Side <- c(replicate(18, "L"), replicate(18, "R"), replicate(30, "L"), replicate(30, "R"))
Control_Volume_L <- c(99, 119, 119, 146, 127, 96, 100, 132, 103, 103, 107, 142, 140, 134, 117, 117, 133, 143)
Control_Volume_R <- c(93, 123, 114, 152, 122, 105, 98, 138, 111, 110, 115, 137, 142, 140, 124, 102, 153, 143)
EPD_Volume_L <- c(132, 115, 140, 102, 130, 131, 110, 124, 102, 111, 93, 92, 94, 104, 92, 115, 144, 118, 104, 132, 90, 102, 94, 112, 106, 105, 79, 114, 104, 108)
EPD_Volume_R <- c(136, 116, 143, 105, 136, 137, 103, 121, 105, 115, 97, 97, 93, 108, 91, 117, 147, 111, 97, 129, 85, 107, 91, 116, 113, 101, 75, 108, 95, 98)
Volume <- c(Control_Volume_L, Control_Volume_R, EPD_Volume_L, EPD_Volume_R)
Control_FA_L <- c(0.43, 0.39, 0.38, 0.58, 0.37, 0.5, 0.35, 0.36, 0.72, 0.38, 0.45, 0.30, 0.47, 0.30, 0.67, 0.34, 0.42, 0.29)
Control_FA_R <- c(0.36, 0.49, 0.55, 0.59, 0.33, 0.41, 0.32, 0.50, 0.59, 0.52, 0.32, 0.40, 0.49, 0.33, 0.46, 0.39, 0.37, 0.33)
EPD_FA_L <- c(0.25, 0.39, 0.36, 0.42, 0.21, 0.40, 0.43, 0.16, 0.31, 0.41, 0.39, 0.40, 0.35, 0.29, 0.31, 0.24, 0.39, 0.36, 0.54, 0.38, 0.34, 0.28, 0.42, 0.33, 0.40, 0.36, 0.42, 0.28, 0.40, 0.41)
EPD_FA_R <- c(0.26, 0.36, 0.36, 0.61, 0.22, 0.33, 0.36, 0.34, 0.35, 0.37, 0.39, 0.45, 0.30, 0.31, 0.50, 0.31, 0.29, 0.43, 0.41, 0.21, 0.38, 0.28, 0.66, 0.33, 0.50, 0.27, 0.46, 0.37, 0.26, 0.39)
FA <- c(Control_FA_L, Control_FA_R, EPD_FA_L, EPD_FA_R)

data <- data.frame(Subject, Group, Side, Volume, FA)

然后我使用nlme软件包对FA值运行线性混合模型：

library(nlme)
lmm <- lme(FA ~ Group + Side + Volume, ~ 1|Subject, data = data)
summary(lmm)

由于“边”不是重要因素，因此已从模型中删除：

lmm <- lme(FA ~ Group + Volume, ~ 1|Subject, data = data)
summary(lmm)

我想对“组”因素（两个级别：“控制”和“患者”）进行事后分析。通常，我将使用multcomp软件包运行以下代码对两个以上级别的因子进行事后分析：

library(multcomp)
summary(glht(lmm, linfct=mcp(Group ="Tukey")))

我不相信杜克多重比较事后，因为我们只有因素有两个层面的考验将是在这种情况下适当的。在这种情况下，适当的事后测试是什么？我希望看到模型估计的“组”因子的两个级别（“控制”和“患者”）之间的差异。任何反馈将不胜感激！

Answer 1

几件事。首先，仅仅因为Side不重要，并不一定是将其从模型中删除的原因。如果有理论上的原因要删除（例如，没有理由将其与结果相关），或者测量/数据本身存在问题，那么删除可能更有效。

第二，由于Group是二进制变量，因此您无需进行任何事后比较。 Group的输出中的系数将代表对照组和患者组之间的平均差异，同时控制模型中的所有其他变量。因此，在包含Side的模型的输出中，患者的FA评分平均比对照组低0.08个单位。如果这个指标本身是有意义的，那么你可能只报告这样说。如果没有，您可能希望对其进行标准化。

希望这会有所帮助。

线性混合模型的事后检验-具有两个水平的因数

1 个答案: