Question

我有一个数据框，例如：

df.columns = ["qseqid", "sseqid", "pident", "length", "mismatch", "gapopen","qstart", "qend", "sstart", "send", "evalue", "bitscore"]

最终的想法是创建一个名为strand的新列

，并且如果start中的值大于结尾，则在相应的行中添加一个+，并且如果start小于end则添加一个-。

这是我的代码：

for a, b in zip(df["qstart"],df["qend"]):
    if a > b:
        df['e'] = '+'
    elif a < b:
        df.['e'] = '-'

但是即使-中的值高于qstart

，我也只能进入qend所表示的列链中。

谢谢您的帮助

df：

qseqid  sseqid  pident  length  mismatch    gapopen qstart  qend    sstart  send    evalue  bitscore
scaffold_1  test    25.5    337 166 9   2   20  27  310 1.0e-16 94.0
scaffold_1  tes2    27.0    278 163 9   500 20  222 487 1.e-16  94.0
scaffold_1  tes4    35.5    166 93  2   3   10  63  227 2.e-15  89.7

我应该得到的休息：

qseqid  sseqid  pident  length  mismatch    gapopen qstart  qend    sstart  send    evalue  bitscore    strand
scaffold_1  test    25.5    337 166 9   2   20  27  310 1.0e-16 94.0    +
scaffold_1  tes2    27.0    278 163 9   500 20  222 487 1.e-16  94.0    -
scaffold_1  tes4    35.5    166 93  2   3   10  63  227 2.e-15  89.7    +

其他部分：

0

我有一个df，例如：

qseqid  sseqid  pident  length  mismatch    gapopen qstart  qend    sstart  send    evalue  bitscore
scaffold_1  test    25.5    337 166 9   2   20  27  310 1.0e-16 94.0
scaffold_1  tes2    27.0    278 163 9   500 20  222 487 1.e-16  94.0
scaffold_1  tes4    35.5    166 93  2   3   10  63  227 2.e-15  89.7

，如果df.qstart，我想更改ds.qend和df.qstart>df.qstart中的值

在这里是：

qseqid  sseqid  pident  length  mismatch    gapopen qstart  qend    sstart  send    evalue  bitscore
    scaffold_1  test    25.5    337 166 9   2   20  27  310 1.0e-16 94.0
    scaffold_1  tes2    27.0    278 163 9   20 500  222 487 1.e-16  94.0
    scaffold_1  tes4    35.5    166 93  2   3   10  63  227 2.e-15  89.7

您可能会发现500取代了20，谢谢您的帮助

Answer 1

您可以使用np.where

df['e']=np.where(df["qstart"]>df["qend"],'+','-')

用熊猫连续更改值

1 个答案: