Question

当同时使用嵌套因子和交互时，我不太确定如何在adonis2输出（纯素食包）中解释“：”。

例如，没有嵌套因素：

        adonis_data <- adonis2(Y ~ 
                       A*B*C , data=factors, 
                       permutations = 9999, method = "euclidean")

        adonis_data

因子之间的相互作用在结果输出中用“：”表示，例如：

   Terms added sequentially (first to last)
        A       ***
        B       ***
        C       ***
        A:C     ***
        B:C     ***

但是，在集成嵌套效果（使用“：”或“ /”）时：

        adonis_data <- adonis2(Y ~ 
                       A:B*C , data=factors, 
                       permutations = 9999, method = "euclidean")

        adonis_data

我难以解释此输出，因为我不知道这里显示的嵌套因子（带或不带“：”）

   Terms added sequentially (first to last)
        A      ***
        C      ***
        A:B    ***
        A:C    ***
        A:C:B  ***

所以在这里，我不太确定A：B是否显示了嵌套因子的作用而不是交互作用...

我对此事的最后想法是，如果嵌套因子被写为输出中的相互作用（例如A：B），则考虑到这些术语是按顺序添加的，我们可以通过结果的顺序来区分这两种情况。

所以，如果这是正确的，那意味着嵌套的B应该在A和C之间，而A：B在这里是一种交互作用？

在这里得出A对Y的B效应根据A值而不同是否正确？

有人能启发我吗？非常感谢，劳拉

Answer 1

这是 R 公式的常见问题，对adonis或纯素食主义者而言，并不是什么特别的问题。无论如何，在默认的adonis2（目前仅为adonis）中，测试是顺序的，这实际上意味着之前的术语会影响结果，但是以后（随后的）条款无效。术语是什么，取决于您定义模型的方式，就像您在问题中所展示的那样。

如何用固定的嵌套因子解释permanova adonis的输出？

1 个答案: