sed保留数字并丢弃扩展名

Question

我有一个文件，其中的行标题包含以下模式（制表符分隔）

1.mapped.bam 2.mapped.bam 3.mapped.bam ....

我想要

SAMPLE_1 SAMPLE_2 SAMPLE_3 .....

我尝试过：

sed -r 's/([0-9])(.mapped.bam)/SAMPLE_\1/g 

但是得到了

1SAMPLE_1 2SAMPLE_2 3SAMPLE_3 ???

Answer 1

您可以使用以下POSIX ERE解决方案：

sed -E 's/([0-9]+)\.mapped\.bam/SAMPLE_\1/g'

等效的BRE POSIX解决方案是

sed 's/\([0-9][0-9]*\)\.mapped\.bam/SAMPLE_\1/g'

请参见online sed demo

在这里

• ([0-9]+)-第1组（后来在RHS中用\1占位符表示，替换模式）：一位或多位数字
• \.mapped\.bam-文字.mapped.bam子字符串。

请注意，在POSIX BRE和ERE中，都必须对括号表达式之外的点进行转义以匹配文字点，并且必须以POSIX BRE风格对捕获括号进行转义。