Question

在加载dplyr库时，我注意到R考试包中的行为异常。下面的示例仅在我明确调用dplyr命名空间时才有效，如注释中所示。请注意，该错误仅发生在新的会话中，即您需要重新启动R才能看到我看到的内容。您需要将以下内容放在文件exam.Rmd中，然后调用

library(exams)
library(dplyr)
exams2html("exam.Rmd")  # in pwd

# this is exam.Rmd
```{r datagen,echo=FALSE,results='hide',warning=FALSE,message=FALSE}
df = data.frame(i = 1:4, y = 1:4, group = paste0("g",rep(1:2,2)))
# works:
b2 = diff(dplyr::filter(df,group!="g1")$y)
b3 = diff(dplyr::filter(df,group!="g2")$y)
# messes up the complete exercise:
# b2 = diff(filter(df,group!="g1")$y)
# b3 = diff(filter(df,group!="g2")$y)
nq = 2
questions <- solutions <- explanations <- rep(list(""), nq)
type <- rep(list("num"),nq)

questions[[1]] = "What is the value of $b_2$ rounded to 3 digits?"
questions[[2]] = "What is the value of $b_3$ rounded to 3 digits?"
solutions[[1]] = b2
solutions[[2]] = b3
explanations[[1]] = paste("You have you substract the conditional mean of group 2 from the reference group 1. gives:",b2)
explanations[[2]] = paste("You have you substract the conditional mean of group 3 from the reference group 1",b3)
```


Question
========
You are given the following dataset on two variables `y` and `group`. 

```{r showdata,echo=FALSE}
# kable(df,row.names = FALSE,align = "c")
df
```

some text with math

$y_i = b_0 + b_2 g_{2,i}  + b_3 g_{3,i} + e_i$

```{r questionlist, echo = FALSE, results = "asis"}
answerlist(unlist(questions), markup = "markdown")
```

Solution
========

```{r sollist, echo = FALSE, results = "asis"}
answerlist(unlist(explanations), markup = "markdown")
```

Meta-information
================
extype: cloze
exsolution: `r paste(solutions,collapse = "|")`
exclozetype: `r paste(type, collapse = "|")`
exname: Dummy Manual computation
extol: 0.001

Answer 1

感谢提出此问题，并致@hrbrmstr解释问题的一部分。但是，仍然缺少一部分解释：

当然，问题的根源是stats和dplyr都导出不同的filter()函数。并且取决于各种因素，首先发现哪个功能。
在交互式会话中，以正确的顺序加载软件包就足够了，其中stats被自动加载，随后dplyr被自动加载。因此，它起作用了：
library("knitr")
library("dplyr")
knit("exam.Rmd")
花了我一会儿时间才知道有什么不同：
library("exams")
library("dplyr")
exams2html("exam.Rmd")
事实证明，在后一个代码块中，knit()由exams2html()调用，因此NAMESPACE包中的exams会更改搜索路径，因为它会完全导入整个stats软件包。因此，除非在加载了stats::filter()的环境（如dplyr::filter()中对代码进行评估，否则dplyr会在.GlobalEnv之前找到。（有关更多详细信息，请参见@hrbrmstr的答案）

由于没有迫切的理由要求exams包导入整个stats包，因此我将NAMESPACE更改为仅选择性地导入所需的功能（不包括filter()函数）。请从R-Forge安装开发版本：

install.packages("exams", repos = "http://R-Forge.R-project.org")

然后只需将dplyr::...包括在.Rmd中或调用library("dplyr")之前，就可以不使用exams2html()来编译.Rmd。两者现在都应该按预期工作。

Answer 2

使用您的exams.Rmd，这是我要在其中输入cmd输入的源窗格：

（我添加了quiet=FALSE，所以我可以看到发生了什么事。）

这是输入cmd后的控制台输出：

这是输出：

如果您一直从全文阅读到knit上的帮助：

envir：要在其中评估代码块的环境，例如parent.frame()，new.env()或globalenv()）。

与您所做的相比，parent.frame()或globalenv()是必需的（您似乎并不完全了解环境）。您从TRUE调用中获得了exists()，因为默认情况下 inherits在TRUE函数中为exists，并且告诉该函数“ [搜索]环境的封闭框架” （来自exists的帮助。

而且，您应该深切关注源代码和分类错误。您正在使用一种编程语言和开放源代码软件，很正确的说library(dplyr)在Rmd中不起作用，这是由于“ great” 软件包中的一些糟糕的代码选择所致，您不想指出，因为您不想看源代码。

结束，因为我无法为您做更多。我只是希望其他人能从中受益。

R考试使用dplyr打包了奇怪的行为

2 个答案: