Question

我正在尝试读取由LISREL以下列格式在纯文本，空白分隔文件中写出的方差 - 协方差矩阵：

 0.23675E+01  0.86752E+00  0.28675E+01 -0.36190E+00 -0.36190E+00  0.25381E+01
-0.32571E+00 -0.32571E+00  0.84425E+00  0.25598E+01 -0.37680E+00 -0.37680E+00
 0.53136E+00  0.47822E+00  0.21120E+01 -0.37680E+00 -0.37680E+00  0.53136E+00
 0.47822E+00  0.91200E+00  0.21120E+01

这实际上是一个较低的对角矩阵（包括对角线）：

 0.23675E+01  
 0.86752E+00  0.28675E+01 
-0.36190E+00 -0.36190E+00  0.25381E+01
-0.32571E+00 -0.32571E+00  0.84425E+00  0.25598E+01 
-0.37680E+00 -0.37680E+00  0.53136E+00  0.47822E+00  0.21120E+01 
-0.37680E+00 -0.37680E+00  0.53136E+00  0.47822E+00  0.91200E+00  0.21120E+01

我可以使用scan()或read.table(fill=T)正确读取值。

但是我无法将读入的矢量正确存储在矩阵中。以下代码

S <- diag(6)
S[lower.tri(S,diag=T)] <- d

按列填充下面的矩阵，而它应该按行填充。

使用matrix()确实允许选项byrow=TRUE，但这将填充整个矩阵，而不仅仅是下半部分（带对角线）。

是否可以同时使用：只填充下方矩阵（带对角线）和按行填充？

（单独的问题我有：LISREL使用'D + 01'，而R只识别'E + 01'用于科学记数法。你可以在R中改变它以接受'D'吗？）

Answer 1

只需将其读入上三角部分，而不是下部：

S <- diag(6)
S[upper.tri(S, diag=TRUE)] <- d
t(S)

Answer 2

sem包具有非常好的功能，read.moments()旨在实现此目的：

foo <- read.moments()
 0.23675E+01  
 0.86752E+00  0.28675E+01 
-0.36190E+00 -0.36190E+00  0.25381E+01
-0.32571E+00 -0.32571E+00  0.84425E+00  0.25598E+01 
-0.37680E+00 -0.37680E+00  0.53136E+00  0.47822E+00  0.21120E+01 
-0.37680E+00 -0.37680E+00  0.53136E+00  0.47822E+00  0.91200E+00  0.21120E+01

foo[upper.tri(foo)] <- t(foo)[upper.tri(foo)]

这会给你：

         X1       X2       X3       X4       X5       X6
X1  2.36750  0.86752 -0.36190 -0.32571 -0.37680 -0.37680
X2  0.86752  2.86750 -0.36190 -0.32571 -0.37680 -0.37680
X3 -0.36190 -0.36190  2.53810  0.84425  0.53136  0.53136
X4 -0.32571 -0.32571  0.84425  2.55980  0.47822  0.47822
X5 -0.37680 -0.37680  0.53136  0.47822  2.11200  0.91200
X6 -0.37680 -0.37680  0.53136  0.47822  0.91200  2.11200

EDIT1：关于scan()的问题，仅因为它最初打印为下三角形并不意味着你必须将它放在下三角形中:)只需将它放在上面：

foo <- scan()
 0.23675E+01  
 0.86752E+00  0.28675E+01 
-0.36190E+00 -0.36190E+00  0.25381E+01
-0.32571E+00 -0.32571E+00  0.84425E+00  0.25598E+01 
-0.37680E+00 -0.37680E+00  0.53136E+00  0.47822E+00  0.21120E+01 
-0.37680E+00 -0.37680E+00  0.53136E+00  0.47822E+00  0.91200E+00  0.21120E+01

bar <- matrix(0,6,6)

bar[upper.tri(bar,diag=TRUE)] <- foo

bar[lower.tri(bar)] <- t(bar)[lower.tri(bar)]

EDIT2：关于D符号的问题，如果我理解正确，可以通过先扫描字符来修复，gsub D到E并强制为数字：

foo <- scan(what="character")
 0.23675D+01  
 0.86752D+00  0.28675D+01 
-0.36190D+00 -0.36190D+00  0.25381D+01
-0.32571D+00 -0.32571D+00  0.84425D+00  0.25598D+01 
-0.37680D+00 -0.37680D+00  0.53136D+00  0.47822D+00  0.21120D+01 
-0.37680D+00 -0.37680D+00  0.53136D+00  0.47822D+00  0.91200D+00  0.21120D+01


bar <- matrix(0,6,6)

bar[upper.tri(bar,diag=TRUE)] <- as.numeric(gsub("D","E",foo))

bar[lower.tri(bar)] <- t(bar)[lower.tri(bar)]

bar

逐行填充下部矩阵，而不是列

2 个答案: