如何使用熊猫编写分区的Parquet文件

时间:2018-10-22 16:56:58

标签: python pandas parquet pyarrow

我正在尝试将Pandas数据帧写入分区文件:

df.to_parquet('output.parquet', engine='pyarrow', partition_cols = ['partone', 'partwo'])

TypeError: __cinit__() got an unexpected keyword argument 'partition_cols'

从文档中,我预计partition_cols将作为kwargs传递给pyarrow库。如何使用熊猫将分区文件写入本地磁盘?

4 个答案:

答案 0 :(得分:3)

首先确保您拥有最新版本的 Pandas 和 pyarrow:

pyenv shell 3.8.2
python -m venv venv
source venv/bin/activate
pip install pandas pyarrow
pip freeze | grep pandas # pandas==1.2.3
pip freeze | grep pyarrow # pyarrow==3.0.0

然后您可以使用 partition_cols 生成分区的镶木地板文件:

import pandas as pd

# example dataframe with 3 rows and columns year,month,day,value
df = pd.DataFrame(data={'year':  [2020, 2020, 2021],
                        'month': [1,12,2], 
                        'day':   [1,31,28], 
                        'value': [1000,2000,3000]})

df.to_parquet('./mydf', partition_cols=['year', 'month', 'day'])

这会产生:

mydf/year=2020/month=1/day=1/6f0258e6c48a48dbb56cae0494adf659.parquet
mydf/year=2020/month=12/day=31/cf8a45116d8441668c3a397b816cd5f3.parquet
mydf/year=2021/month=2/day=28/7f9ba3f37cb9417a8689290d3f5f9e6e.parquet

答案 1 :(得分:2)

熊猫DataFrame.to_parquettable = pa.Table.from_pandas(...)pq.write_table(table, ...)的瘦包装(请参阅pandas.parquet.py#L120),而pq.write_table不支持写入分区数据集。您应该改用pq.write_to_dataset

import pandas as pd
import pyarrow as pa
import pyarrow.parquet as pq

df = pd.DataFrame(yourData)
table = pa.Table.from_pandas(df)

pq.write_to_dataset(
    table,
    root_path='output.parquet',
    partition_cols=['partone', 'parttwo'],
)

有关更多信息,请参见pyarrow documentation

通常,在读取/写入镶木地板文件时,我总是会直接使用PyArrow API,因为Pandas包装器的功能相当有限。

答案 2 :(得分:1)

您需要更新到Pandas 0.24或更高版本。从该版本开始添加partition_cols的功能。

答案 3 :(得分:0)

使用dask和fastparquet,说你想要8个分区:

import dask.dataframe as dd
_ = dd.from_pandas(df, npartitions= 8) \ 
        .to_parquet('my_pq.parquet', engine='fastparquet')