Question

比方说，我想让我的计算机每分钟计算一次我的年龄，因此我每天都要执行以下计划任务：

*/1 * * * * bash /path/to/birthCalc

birthCalc本身会调用R脚本，如下所示：

#!/bin/bash 
Rscript birthCalc.R

现在，如果我将base R与这样的birthCalc.R一起使用，这一切都可行：

birthDay <- as.POSIXct ('1919-04-15', format = '%Y-%m-%d')
age <- floor ((as.numeric (Sys.time ()) - as.numeric (birthDay))/(365.25*60*60*24))

但是，如果我尝试通过lubridate库使用以下脚本，那么它将不再起作用。

library ('lubridate')
birthDay <- as.POSIXct ('1919-04-15', format = '%Y-%m-%d')
age <- floor (lubridate::time_length (Sys.time () - birthDay, "years"))

如果我在cron作业中运行installed.packages ()，则会列出lubridate，因此我认为cron作业应该能够找到该库。我在其他库中也遇到了这个问题，但是选择lubridate作为示例。

该脚本仅在作为cron作业运行时失败。我可以从bash终端或在R中以交互方式很好地运行它。我检查了cron是否使用相同的Rscript和R，以及这些软件包是否可访问。我想念什么？

我正在跑步：

R版本3.4.4（2018-03-15）

平台：带有Ubuntu 16.04.5 LTS的x86_64-pc-linux-gnu（64位）

lubridate_1.7.4

非常感谢， TTR

Answer 1

我找到了解决方案。它似乎与权限有关。我最初以root用户身份创建了cron作业，并尝试为用户创建它。使用crontab -u user -e代替sudo crontab -e解决了该问题。尽管将库安装在可访问的目录中，但有人知道为什么这是一个问题吗？

当Rscript作为cron作业调用时，R包（例如lubridate）不起作用

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