如何衡量由层次聚类产生的两个聚类树之间的相似性？

Question

我想对不同的数据集应用分层聚类方法（即聚集聚类）。我想比较最终的聚类树。有什么解决办法吗？提前致谢。

Answer 1

有很多方法可以做到这一点。 我建议您查看小插图中的dendextend的“比较两个树状图”部分：

https://cran.r-project.org/web/packages/dendextend/vignettes/introduction.html#comparing-two-dendrograms

最简单的使用方法可能是cor_cophenetic函数。