使用MacOS终端在同一目录中的多个VCF文件上执行Plink

时间:2018-09-11 23:42:54

标签: bash loops command vcf

我目前有许多VCF文件,我正在将它们转换为plink格式。我是通过使用以下参数从终端运行plink来实现的。

./ plink --vcf BH4_F3_F2.g.vcf.gz --recode --const-fid --allow-extra-chr --out BH4_F3_F2

但是我需要在大约100个使用不同名称的命令上运行此命令  例如BH4_F3_F2.g.vcf.gz       BH4_F2_F1.g.vcf.gz

有没有一种方法可以不必单独执行每个操作?

1 个答案:

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检查0 10 0 ['ok', 'ok', 'ok', 'ok', 'ok', 'ok', 'ok', 'ok', 'ok', 'ok', 'ok', 'ok', 'ok', 'ok', 'ok', 'ok', 'ok', 'ok', 'ok', 'ok'] 5 循环语法。像

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