从ggord NMDS图中删除物种名称和箭头

时间:2018-08-22 15:40:40

标签: r mds

我用ggord在R中创建了NMDS图。它同时显示了图和物种,但是我也想从图中删除所有物种名称和箭头。有解决办法吗?

这是我的代码:

ggord(spherblr.nmds, envherblr$ecoutil, 
      cols=c("red", "lightcoral", "chocolate", "orange", "darkgreen", "yellowgreen"))+
  scale_shape_manual("Groups", values=c(15, 0, 19, 1, 17, 2))+
  theme(panel.grid.major = element_blank(), panel.grid.minor = element_blank())+
  geom_text(mapping = NULL, label="none")

我的情节如下:NMDS plot

2 个答案:

答案 0 :(得分:1)

您可以将txt = NULL传递到ggord以禁止显示文本标签,而将veclsz = 0禁止显示箭头:

ord = prcomp(iris[, 1:4])
ggord(ord, iris$Species, txt = NULL, veclsz = 0)

PCA of iris

答案 1 :(得分:0)

因此,在我看来,以下ggord(ord, iris$Species, txt = NULL, vectyp=0)