Question

我正在尝试从源代码构建第三方C ++库，这取决于Boost。在构建的最后一步，我得到了如下错误：

[ 90%] Linking CXX executable Shannon_RNASeq_Cpp
CMakeFiles/Shannon_RNASeq_Cpp.dir/src/main.cpp.o: In function `command_line_for_find_rep(int, char**, Shannon_C_setting&, 
std::__cxx11::basic_string<char, std::char_traits<char>, 
std::allocator<char> >&, std::__cxx11::basic_string<char, 
std::char_traits<char>, std::allocator<char> >&)':
/home/lambda/Shannon_Cpp_RNA_seq/src/main.cpp:320: undefined reference to `boost::program_options::options_description::options_description(std::__cxx11::basic_string<char, std::char_traits<char>, std::allocator<char> > const&, unsigned int, unsigned int)'

我在StackOverflow上搜索了其他问题（例如Boost Program Options link error），最初认为这是由用于构建Boost的非标头部分的不同编译器引起的，因此我下载了Boost 1.68.0的源代码并使用与构建第3方库（编译器为gcc 8.2.0）相同的编译器将其构建在我的个人目录中，从错误消息中，我可以确定使用了C ++ 11标准（您可以看到错误消息中的cxx11），因此不可能像先前所假设的那样，不支持C ++ 11的编译器引起麻烦。为了使用自定义编译器构建Boost（服务器的默认编译器已经过时了），我遵循了undefined reference to boost::program_options in xubuntu的说明。

一些进一步的搜索显示这是一个链接问题。第三方库必须由CMake构建，并且我将上一行添加到第三方库的根目录中的CMakeLists.txt中来遵循上一个问题（here）的说明：

target_link_libraries(Shannon_RNASeq_Cpp ${Boost_PROGRAM_OPTIONS_LIBRARY_RELEASE})

但是，相同的问题仍然存在。我检查了文件CMakeCache.txt，并确认已使用所需的编译器，并且Boost_PROGRAM_OPTIONS_LIBRARY_RELEASE指向我放置Boost 1.68.0的目录中的libboost_program_options.so（服务器具有其他较旧的版本促进）。然后，我使用make VERBOSE=1检查在构建库时调用的bash命令。该命令听起来没有错； Boost program_options库已链接；这是来自make VERBOSE=1的命令：

/usr/bin/cmake3 -E cmake_link_script CMakeFiles/Shannon_RNASeq_Cpp.dir/link.txt --verbose=1

它是指link.txt中的某物，这是我在那发现的：

/home/lambda/mylibs/bin/c++  -g  -rdynamic CMakeFiles/Shannon_RNASeq_Cpp.dir/src/main.cpp.o 
CMakeFiles/Shannon_RNASeq_Cpp.dir/src/run_tasks.cpp.o  -o 
Shannon_RNASeq_Cpp lib_shannon/libmulti_graph_handler.a 
lib_shannon/libcontig_graph_handler.a lib_shannon/libprimary_lib.a 
-lboost_program_options lib_shannon/libsparse_flow_handler.a 
-lglpk lib_shannon/libseq_graph_handler.a -lpthread 
-lboost_system -Wl,-Bstatic -lmetis -Wl,-Bdynamic -lboost_filesystem 
-lboost_program_options

是的，Boost program_options已被链接（-lboost_program_options）。我不知道program_options是否有问题，因为在此阶段发生的所有错误均来自program_options。我还链接了另外2个Boost编译库，即文件系统和系统，它们没有出现在我在这里看到的任何错误消息中。

我自己解决了这个问题（请参阅下面的答案），但是对CMake还是陌生的（我对C ++的唯一经验是Rcpp），我不知道它为什么起作用。有人可以解释一下为什么切换到静态库有效吗？另外，当CMake链接到服务器上默认的Boost版本时，即使.so可用，它默认也使用.a而不是.a。有什么方法可以告诉CMake使用.a而不是.so？还有其他解决方案吗？

Answer 1

我所做的是将.so中的所有CMakeCache.txt更改为.a，就像我将libboost_program_options.so更改为libboost_program_options.a一样，此错误消失了。远。然后来自make VERBOSE=1的命令变为：

/home/lambda/mylibs/bin/c++  -g  -rdynamic CMakeFiles/Shannon_RNASeq_Cpp.dir/src/main.cpp.o 
CMakeFiles/Shannon_RNASeq_Cpp.dir/src/run_tasks.cpp.o  
-o Shannon_RNASeq_Cpp lib_shannon/libmulti_graph_handler.a 
lib_shannon/libcontig_graph_handler.a lib_shannon/libprimary_lib.a 
-Wl,-Bstatic -lboost_program_options lib_shannon/libsparse_flow_handler.a 
-Wl,-Bdynamic -lglpk lib_shannon/libseq_graph_handler.a -lpthread 
-Wl,-Bstatic -lboost_system -lmetis -lboost_filesystem -lboost_program_options -Wl,-Bdynamic

Boost program_options中的链接错误

1 个答案: