系统R命令与shell输出不同

Question

我的系统中安装了ubuntu的默认python和Anaconda Python。当我在R中运行系统命令时：

> system('which python')
/usr/bin/python

但是从shell：

user@user:~/Documents/Rad/jee/Solver$ which python
/home/user/anaconda2/bin/python

也是从Rscript命令行模式：

user@user:~/Documents/Rad/jee/Solver$ Rscript -e "system('which python')"
/home/user/anaconda2/bin/python

R系统命令提供不同的输出可能有所不同。

Answer 1

经过一些调试后，我找到了Anaconda在PATH中添加python可执行文件路径的答案。 Anaconda将其添加到.bashrc中，而bashrc仅在bash中可用，因此当我在终端中执行任何操作时都可以看到它。但是，看起来R系统命令进行了sh调用。因此，anaconda python在R系统命令输出中不可用。

将anaconda设置从.bashrc移到.profile文件后；问题解决了。