我正在一个项目中进行工作,该项目涉及许多非常大的文件,其中一些是原始数据,一些中间结果。仅在一台相当快的计算机上加载所有这些文件,就需要20分钟。结果,我没有像以前那样频繁地重建工作区。
每当我打开RStudio时,甚至在触摸键盘之前,第一件事就是
Loading required package: sp
我也不知道为什么。尽管sp
是由我稍后加载的其他软件包加载的,但是这种早期加载有时会引起问题。例如,当sp
版本更改时,由于不加载R,因此无法更新我的软件包。当我尝试使用detach()
卸载并重新安装更新的版本时,出现了lazy-load database is corrupt
错误。
在我看来,问题几乎必须存在于我的.Rprofile
或.Rprofile.site
文件中。我已经确定了我的R_HOME
,HOME
和工作目录,如下所示:
R.home()
用于安装R的目录:C:/PROGRA~1/R/R-35~1.0
path.expand("~")
用户的主目录:D:/ Documents和
getwd()
对于当前工作目录:D:/ Documents / R / middle_class
尽管过去我有更多活动的.Rprofile文件,但是这些位置中只有一个包含当前内容:.Rprofile.site
中的C:\Program Files\R\R-3.5.0\etc
包含一个.Rprofile.site
文件,如果该会话是交互式的,并且我刚刚添加的Renviron.site文件将我的HOME目录从D:/Document
重置为D:/Documents/R
加载sp的命令还从哪里来?
我的会话信息在下面
> sessionInfo()
R version 3.5.0 (2018-04-23)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows >= 8 x64 (build 9200)
Matrix products: default
locale:
[1] LC_COLLATE=English_United States.1252 LC_CTYPE=English_United States.1252 LC_MONETARY=English_United States.1252
[4] LC_NUMERIC=C LC_TIME=English_United States.1252
attached base packages:
[1] grid stats graphics grDevices utils datasets methods base
other attached packages:
[1] ggthemes_3.5.0 viridis_0.5.1 viridisLite_0.3.0 RColorBrewer_1.1-2 prettydoc_0.2.1
[6] cartogram_0.1.0 rgdal_1.3-3 maptools_0.9-2 maps_3.3.0 DiagrammeR_1.0.0
[11] DependenciesGraphs_0.3 XML_3.98-1.12 shinydashboard_0.7.0 visNetwork_2.0.4 ipumsr_0.2.0
[16] pracma_2.1.4 GB2_2.1 survey_3.33-2 Matrix_1.2-14 devtools_1.13.6
[21] reprex_0.2.0 installr_0.20.0 broom_0.5.0 Hmisc_4.1-1 Formula_1.2-3
[26] survival_2.41-3 lattice_0.20-35 haven_1.1.2 feather_0.3.1 magrittr_1.5
[31] rlang_0.2.1 pryr_0.1.4 forcats_0.3.0 stringr_1.3.1 dplyr_0.7.6
[36] purrr_0.2.5 readr_1.1.1 tidyr_0.8.1 tibble_1.4.2 ggplot2_3.0.0
[41] tidyverse_1.2.1 sp_1.3-1
loaded via a namespace (and not attached):
[1] cubature_1.4 colorspace_1.3-2 class_7.3-14 rprojroot_1.3-2 htmlTable_1.12
[6] base64enc_0.1-3 rstudioapi_0.7 lubridate_1.7.4 xml2_1.2.0 codetools_0.2-15
[11] splines_3.5.0 knitr_1.20 zeallot_0.1.0 rlist_0.4.6.1 jsonlite_1.5
[16] cluster_2.0.7-1 rgeos_0.3-28 compiler_3.5.0 httr_1.3.1 backports_1.1.2
[21] assertthat_0.2.0 lazyeval_0.2.1 cli_1.0.0 acepack_1.4.1 htmltools_0.3.6
[26] tools_3.5.0 bindrcpp_0.2.2 igraph_1.2.1 gtable_0.2.0 glue_1.2.0
[31] Rcpp_0.12.17 cellranger_1.1.0 rgexf_0.15.3 nlme_3.1-137 laeken_0.4.6
[36] rvest_0.3.2 hypergeo_1.2-13 MASS_7.3-49 scales_0.5.0 hms_0.4.2
[41] yaml_2.1.19 memoise_1.1.0 gridExtra_2.3 downloader_0.4 rpart_4.1-13
[46] latticeExtra_0.6-28 stringi_1.1.7 Rook_1.1-1 mvbutils_2.7.4.1 e1071_1.6-8
[51] checkmate_1.8.5 contfrac_1.1-12 boot_1.3-20 spData_0.2.9.0 pkgconfig_2.0.1
[56] evaluate_0.11 bindr_0.1.1 sf_0.6-3 htmlwidgets_1.2 tidyselect_0.2.4
[61] deSolve_1.21 plyr_1.8.4 R6_2.2.2 DBI_1.0.0 pillar_1.3.0
[66] foreign_0.8-70 withr_2.1.2 units_0.6-0 nnet_7.3-12 modelr_0.1.2
[71] crayon_1.3.4 rmarkdown_1.10 readxl_1.1.0 data.table_1.11.4 influenceR_0.1.0
[76] digest_0.6.15 classInt_0.2-3 numDeriv_2016.8-1 brew_1.0-6 elliptic_1.3-7
[81] munsell_0.5.0