Question

我正在尝试创建一个程序，用其他字母替换字母，例如将'Q'替换为'R'，或将'D'替换为'U'。我被困在这里：

def dna():
    seq = input('Enter the sequence:')
    list1 = list(seq)
    for i in seq:
       if i == 'A':
           seq[i] = 'T'
    return ''.join(list1)

这会返回错误。我该怎么办？

Answer 1

您的问题有很多答案，但没有一个解决您的问题，因此请查看您的代码，希望这可以提供帮助：

seq是一个字符串，因此在python中是不可变的，所以：

seq[i] = 'T'

无效的python。您已经创建了list1，所以您的意思是：

list1[i] = 'T'

请注意，这仍然无效，因为i不是索引，而是seq中的字符，但您可以使用enumerate()获取索引和字符，例如：

for i, c in enumerate(seq):
    if c == 'A':
        list1[i] = 'T'
...

在python中str.translate()非常适合翻译多个字符，例如举个简单的例子：

def dna():
    t = str.maketrans('A', 'T')
    seq = input('Enter the sequence: ')
    return seq.translate(t)

这很容易扩展，例如A->T和G->C反之亦然：

    t = str.maketrans('AGTC', 'TCAG')

Answer 2

如果它像将一个字符翻译成另一个字符一样简单，您可以使用替换。这是你想要的吗？

  function setKey(agent) {
    var myRegexp = /my (?:key|API key) is (.*)/gi;
    var queryText = request.body.queryResult.queryText;
    var match = myRegexp.exec(queryText);
    conv.user.storage.apiKey = match[1];
    conv.ask('Ok, saving ' + match[1]);
    agent.add(conv);
  }

Answer 3

您可以使用str.replace：

  eslint --init

<强>输出：

def dna(seq):
  # Replace Q with R
  seq = seq.replace("Q", "R")
  # Replace D with U
  seq = seq.replace("D", "U")
  return seq

seq = input('Enter the sequence:')
print(dna(seq))

Answer 4

这是使用理解和查找字典的一种方式，它应该更容易扩展以包含更多字符：

mapping = {'Q': 'R', 'D': 'U'}
seq = input('Enter the sequence:')
new = ''.join(mapping.get(c, c) for c in seq)

示例输入'QUAD'变为'RUAU'。

Answer 5

我只想制作一个简单的代码，将A（Adenin）转换成 T（Thymin），G（Guanin）成C（Cytosin），反之亦然。

基于此澄清，您实际想要做的是补充您的DNA序列。 Biopython提供此功能：

>>> from Bio.Seq import Seq
>>> seq = Seq('ATCGGAT')
>>> seq.complement()
Seq('TAGCCTA', Alphabet())

如果需要，您可以构建自己的实现，biopython以字母识别的方式使用str.translate（检查您的混合DNA / RNA等），请参阅source code。

Answer 6

def dna():
    d={'Adenin':'Thymin','Thymin':'Adenin','Guanin':'Cytosin','Cytosin':'Guanin'}
    seq = raw_input('Enter the sequence:')
    return d[seq]
print dna()

简单来说，您可以尝试制作字典并尝试将A（Adenin）转换为T（Thymin），G（Guanin）转换为C（Cytosin），反之亦然。

如何制作一个“翻译”字母的程序？

6 个答案: