我有一个宽数据帧(130000行x 8700列),当我尝试对所有列求和时,我收到以下错误:
线程“main”java.lang.StackOverflowError中的异常 在scala.collection.generic.Growable $$ anonfun $$加上$ plus $ eq $ 1.apply(Growable.scala:59) 在scala.collection.generic.Growable $$ anonfun $$加上$ plus $ eq $ 1.apply(Growable.scala:59) 在scala.collection.IndexedSeqOptimized $ class.foreach(IndexedSeqOptimized.scala:33) 在scala.collection.mutable.WrappedArray.foreach(WrappedArray.scala:35) 在scala.collection.generic.Growable $ class。$ plus $ plus $ eq(Growable.scala:59) 在scala.collection.mutable.ListBuffer。$ plus $ plus $ eq(ListBuffer.scala:183) 在scala.collection.mutable.ListBuffer。$ plus $ plus $ eq(ListBuffer.scala:45) 在scala.collection.generic.GenericCompanion.apply(GenericCompanion.scala:49) 在org.apache.spark.sql.catalyst.expressions.BinaryExpression.children(Expression.scala:400) 在org.apache.spark.sql.catalyst.trees.TreeNode.containsChild $ lzycompute(TreeNode.scala:88) ...
这是我的Scala代码:
val df = spark.read
.option("header", "false")
.option("delimiter", "\t")
.option("inferSchema", "true")
.csv("D:\\Documents\\Trabajo\\Fábregas\\matrizLuna\\matrizRelativa")
val arrayList = df.drop("cups").columns
var colsList = List[Column]()
arrayList.foreach { c => colsList :+= col(c) }
val df_suma = df.withColumn("consumo_total", colsList.reduce(_ + _))
如果我对几列做同样的事情它可以正常工作,但是当我尝试使用大量列的reduce操作时,我总是得到相同的错误。
任何人都可以建议我该怎么办?列数有限制吗?
THX!
答案 0 :(得分:5)
您可以使用另一种缩小方法来生成深度为O(log(n))
的平衡二叉树,而不是退化的线性化BinaryExpression
深度链O(n)
:
def balancedReduce[X](list: List[X])(op: (X, X) => X): X = list match {
case Nil => throw new IllegalArgumentException("Cannot reduce empty list")
case List(x) => x
case xs => {
val n = xs.size
val (as, bs) = list.splitAt(n / 2)
op(balancedReduce(as)(op), balancedReduce(bs)(op))
}
}
现在在您的代码中,您可以替换
colsList.reduce(_ + _)
通过
balancedReduce(colsList)(_ + _)
一个小例子来进一步说明BinaryExpression
s会发生什么,可编译而没有任何依赖:
sealed trait FormalExpr
case class BinOp(left: FormalExpr, right: FormalExpr) extends FormalExpr {
override def toString: String = {
val lStr = left.toString.split("\n").map(" " + _).mkString("\n")
val rStr = right.toString.split("\n").map(" " + _).mkString("\n")
return s"BinOp(\n${lStr}\n${rStr}\n)"
}
}
case object Leaf extends FormalExpr
val leafs = List.fill[FormalExpr](16){Leaf}
println(leafs.reduce(BinOp(_, _)))
println(balancedReduce(leafs)(BinOp(_, _)))
这是普通的reduce
所做的(这是你代码中实际发生的事情):
BinOp(
BinOp(
BinOp(
BinOp(
BinOp(
BinOp(
BinOp(
BinOp(
BinOp(
BinOp(
BinOp(
BinOp(
BinOp(
BinOp(
BinOp(
Leaf
Leaf
)
Leaf
)
Leaf
)
Leaf
)
Leaf
)
Leaf
)
Leaf
)
Leaf
)
Leaf
)
Leaf
)
Leaf
)
Leaf
)
Leaf
)
Leaf
)
Leaf
)
这是balancedReduce
产生的结果:
BinOp(
BinOp(
BinOp(
BinOp(
Leaf
Leaf
)
BinOp(
Leaf
Leaf
)
)
BinOp(
BinOp(
Leaf
Leaf
)
BinOp(
Leaf
Leaf
)
)
)
BinOp(
BinOp(
BinOp(
Leaf
Leaf
)
BinOp(
Leaf
Leaf
)
)
BinOp(
BinOp(
Leaf
Leaf
)
BinOp(
Leaf
Leaf
)
)
)
)
线性化链的长度为O(n)
,当Catalyst试图评估它时,它会吹掉堆栈。深度为O(log(n))
的扁平树不应该发生这种情况。
虽然我们正在讨论渐近运行时:为什么要附加一个可变的colsList
?这需要O(n^2)
时间。为什么不简单地在toList
的输出上调用.columns
?