给出一个字符串来定义drake中的文件依赖项

Question

我正在学习drake来定义我的分析工作流程，但我无法将数据文件作为依赖项。

我在file_in()中使用函数drake_plan()但它只有在我直接给出文件路径时才有效。如果我使用file.path()函数或存储该文件路径的变量给它，它就不起作用。

示例：

# preparation
library(drake)

path.data <- "data"
dir.create(path.data)
write.csv(iris, file.path(path.data, "iris.csv"))

工作计划：

# working plan
working_plan <-
  drake_plan(iris_data = read.csv(file_in("data/iris.csv")),
             strings_in_dots = "literals")
working_config <- make(working_plan)
vis_drake_graph(working_config)

此计划正常，文件data/iris.csv被视为依赖

Working plan

不工作计划：

# not working
notworking_plan <-
  drake_plan(iris_data = read.csv(file_in(file.path(path.data, "iris.csv"))),
             strings_in_dots = "literals")
notworking_config <- make(notworking_plan)
vis_drake_graph(notworking_config)

此处尝试阅读文件iris.csv而不是data/iris.csv。

工作但依赖性问题：

# working but "data/iris.csv" is not considered as a dependency
file.name <- file.path(path.data, "iris.csv")
notworking_plan <-
  drake_plan(iris_data = read.csv(file_in(file.name)),
             strings_in_dots = "literals")
notworking_config <- make(notworking_plan)
vis_drake_graph(notworking_config)

这最后一个工作正常，但该文件不被视为依赖项，因此如果更改此文件，drake不会重新运行该计划。

Not working drake plan

那么，有没有办法从变量中告诉drake文件依赖？

Answer 1

每次tidyeval，如果在!!前面添加file.path()，它将被评估并且不被引用。

此外，在新版的Drake中，不推荐使用strings_in_dots = "literals"参数。

library(drake)
path.data <- "data"
dir.create(path.data)
write.csv(iris, file.path(path.data, "iris.csv"))

# now working
notworking_plan <-
  drake_plan(iris_data = read.csv(file_in(!!file.path(path.data, "iris.csv"))))
notworking_plan
#> # A tibble: 1 x 2
#>   target    command                           
#>   <chr>     <expr>                            
#> 1 iris_data read.csv(file_in("data/iris.csv"))

^{由reprex package（v0.2.1）于2019-05-08创建}

Answer 2

在Github上的开发人员answer之后，img { width: 100%; height: 100%; object-fit: contain; } 中的代码未经过评估，因此无法在其中使用file_in()。