标签: r plot hierarchical-clustering dendrogram
如何在树形图中绘制一条线,对应给定标准的最佳K ?
像这样:
让我们假设这是我的树形图,最好的K是4。
data("mtcars") myDend <- as.dendrogram(hclust(dist(mtcars))) plot(myDend)
我知道abline函数能够在图形中绘制线条,类似于上面显示的线条。但是,我不知道如何计算高度,因此该函数用作abline(h = myHeight)
abline
abline(h = myHeight)
答案 0 :(得分:2)
hclust附带了获得高度所需的信息。它有一个包含高度的变量。要获得4个星团,您需要在第3个最高和第4个高度之间绘制线条。
hclust
HC = hclust(dist(mtcars)) myDend <- as.dendrogram(HC) par(mar=c(7.5,4,2,2)) plot(myDend) k = 4 n = nrow(mtcars) MidPoint = (HC$height[n-k] + HC$height[n-k+1]) / 2 abline(h = MidPoint, lty=2)