Slurm任务id作为Matlab的函数参数

Question

我想以某种方式在slurm中创建一个作业数组，以便它被称为依赖于数组任务ID的Matlab函数。我试过了

#!/bin/bash
#SBATCH -J TEST
#SBATCH -p slims
#SBATCH -o o
#SBATCH -e e

matlab -r "test(${SLURM_ARRAY_TASK_ID})"

其中test.m是我想要运行的matlab函数。抛出错误＆＃34;第7行test.m中没有足够的参数...＆＃34;

我该怎么做？

Answer 1

看起来$SLURM_ARRAY_TASK_ID未定义，并且您的提交文件中没有--array参数。所以除非你在命令行上提供了这个参数

sbatch --array ... <yourscript.sh>

你没有告诉Slurm创建一个数组。

将#SBATCH --array ...添加到提交脚本中，或在命令行中指定它。