我尝试使用H2O为二进制分类问题创建一些机器学习模型,测试结果非常好。但后来我检查并发现了一些奇怪的东西。我试图出于好奇心打印模型的预测。我发现我的模型实际上一直预测0(负),但AUC约为0.65,精度不是0.0。然后我尝试使用Scikit-learn来比较指标得分,并且(如预期的那样)它们是不同的。 Scikit学习得到0.0精度和0.5 AUC分数,我认为这是正确的。这是我使用的代码:
model = h2o.load_model(model_path)
predictions = model.predict(Test_data).as_data_frame()
# H2O version to print the AUC score
auc = model.model_performance(Test_data).auc()
# Python version to print the AUC score
auc_sklearn = sklearn.metrics.roc_auc_score(y_true, predictions['predict'].tolist())
有什么想法?提前谢谢!
答案 0 :(得分:3)
H2O和scikit-learn评分之间没有区别,你只需要了解如何理解输出,这样你就可以准确地比较它们。
如果您查看predictions['predict']
中的数据,您会发现它是预测类,而不是原始预测值。 AUC使用后者,因此您需要使用正确的列。见下文:
import h2o
from h2o.estimators.gbm import H2OGradientBoostingEstimator
h2o.init()
# Import a sample binary outcome train/test set into H2O
train = h2o.import_file("https://s3.amazonaws.com/erin-data/higgs/higgs_train_10k.csv")
test = h2o.import_file("https://s3.amazonaws.com/erin-data/higgs/higgs_test_5k.csv")
# Identify predictors and response
x = train.columns
y = "response"
x.remove(y)
# For binary classification, response should be a factor
train[y] = train[y].asfactor()
test[y] = test[y].asfactor()
# Train and cross-validate a GBM
model = H2OGradientBoostingEstimator(distribution="bernoulli", seed=1)
model.train(x=x, y=y, training_frame=train)
# Test AUC
model.model_performance(test).auc()
# 0.7817203808052897
# Generate predictions on a test set
pred = model.predict(test)
检查输出:
In [4]: pred.head()
Out[4]:
predict p0 p1
--------- -------- --------
0 0.715077 0.284923
0 0.778536 0.221464
0 0.580118 0.419882
1 0.316875 0.683125
0 0.71118 0.28882
1 0.342766 0.657234
1 0.297636 0.702364
0 0.594192 0.405808
1 0.513834 0.486166
0 0.70859 0.29141
[10 rows x 3 columns]
现在与sklearn比较:
from sklearn.metrics import roc_auc_score
pred_df = pred.as_data_frame()
y_true = test[y].as_data_frame()
roc_auc_score(y_true, pred_df['p1'].tolist())
# 0.78170751032654806
在这里你可以看到它们大致相同。 AUC是一种近似方法,因此当您比较不同的实现时,您会看到几位小数后的差异。