在R中，我想列出目录中的文件，并捕获输出，但是从R：system（）和system2（）有两次调用系统。我很好奇这些差异是什么，如果有的话，更重要的是如何使用它们。我找到了一些页面，包括here和here，但我想在这里提供一些示例，以及使用system2（）遇到的错误，包括：
sh：1：ls / home：not found
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在研究之前，我的第一次尝试都在system()完成，因为我不知道system2()。我决定在system2()中重做我的方法以实现可移植性（我正在Linux系统上工作）。这让我发现了一些差异。
首先，列出文件的system()解决方案并将输出保存在变量中：
gseaDirectory<-"/home"
filenames<-system(paste("ls", gseaDirectory, sep=" "), intern=T)
这将一个字符串“/ home”存储到变量gseaDirectory中，这是我的主目录所在的位置。然后，我能够将命令ls，空格sep=" "和我的目录变量gseaDirectory粘贴到linux命令中，以列出所选目录中的所有文件：
ls /home
然后使用添加的system（）参数intern=T将文件列表保存在变量“filenames”中。
这在system2（）中不起作用，只返回错误：
sh：1：ls / home：not found
我们的相同方法稍有改动，等效system2()命令为：
gseaDirectory<-"/home"
filenames<-system2('ls', paste(gseaDirectory, sep=" "), stdout = TRUE)
system2中的第一项是命令，然后是目标文件，后跟stdout=T告诉R我们要将输出存储到变量中，否则我们的命令结果将被打印而不是保存。
希望这有助于某人！