为什么有退出代码1 - 从PHP执行R脚本

Question

我正在尝试通过PHP执行以下简单的R脚本，但如果我放置library()函数调用，我总是得到退出代码1。

library('optparse')
quit()

PHP脚本＆＃39; test.php＆＃39;给出如下：

<?php
$calc = exec("Rscript test.r", $R_output, $R_exitcode);
print $calc_routine;

当我删除library()函数调用时，脚本会生成退出代码0，因此它确保R脚本位置正确。

Answer 1

有an environment variable名为R_LIBS_USER，告诉R在哪里寻找库。默认情况下，它设置为主目录中的子目录。当然，当从Web服务器调用时，您将不会运行它 - 主目录将是不同的。

首先，您需要确定您的库目录是什么。从R，call .libPaths()得到它。

然后，您可以告诉PHP有关更新的值：

<?php
setenv("R_LIBS_USER", "/path/to/your/libraries");
$calc = exec("Rscript test.r", $R_output, $R_exitcode);

或者，在您的R代码中，使用带有参数的.libPaths将库路径设置为新值：

.libPaths('/path/to/your/libraries')
library('optparse')
quit()