将MPI与docker容器一起使用

时间:2018-01-03 13:59:35

标签: docker docker-compose mpi docker-swarm openmpi

我已经基于Ubuntu 16.04创建了一个docker镜像,并且具有运行MPI所需的所有依赖项。

它在docker-hub上公开:https://hub.docker.com/r/orwel84/ubuntu-16-mpi/

我使用此图像来创建MPI容器。我还可以编译一个简单的mpi-hello-world.c(它位于容器内)并用mpirun运行它。

这些是我使用的步骤,(如果你安装了Docker,你也可以重现它们):

  1. docker run -it orwel84/ubuntu-16-mpi bash
  2. (在容器的外壳上) mpirun -np 4 --allow-run-as-root ./mpi_hello_world
  3. 您将看到输出:

    Hello world from processor 6f9b11cef939, rank 0 out of 4 processors
    
    Hello world from processor 6f9b11cef939, rank 1 out of 4 processors
    
    Hello world from processor 6f9b11cef939, rank 2 out of 4 processors
    
    Hello world from processor 6f9b11cef939, rank 3 out of 4 processors
    

    问题:

    现在所有上述四个mpi进程都在一个容器内运行。

    如何在单个主机上使用mpirun在多个容器上运行?还有我如何使用Docker swarm在swarm的多个节点上运行?

    请帮忙。三江源。

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

用于单台机器中的多个容器:

1.您可以在一台主机上创建多个容器并检查其IP地址(在docker bridge网络下)。

docker inspect -f "{{ .NetworkSettings.IPAddress }}" containerName

2。现在附加到其中一个容器并创建一个主机文件,列出您创建的容器的IP地址。

3.现在运行应用程序:

mpirun -np 4 -hostfile hostfile_you_created ./mpi_hello_world