在R上运行CellNet时未加载dyld

Question

我正在尝试按照我的MacOS 10.12.6上使用CellNet和RNA-seq（Radley A.H.et al。Nature 2017）评估工程细胞的文章来运行CellNet协议。

我根据需要安装了R, CellNet package, Salmon, and cutadapt。

但是，当我运行命令时（步骤6）：

$expList<-cn_salmon(stQuery, refDir="ref/",salmonIndex=iFileHuman, geneTabfname="geneToTrans_Homo_sapiens.GRCh38.80.exo_Jul_04_2015.R", salmonPath=pathToSalmon)

出现了这个错误：

dyld: Library not loaded: @rpath/libtbb.dylib
  Referenced from: /Users/me/CellNetLocal/Salmon/bin/salmon
  Reason: image not found

任何人都可以帮忙吗？谢谢！

Answer 1

这个问题的解决方案最终被证明是在下载旧版本的鲑鱼（0.7.3），因为目前CellNet中的索引与大于0.8的鲑鱼版本不兼容。*。因此，请确保安装旧版的鲑鱼。