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Question

我正在尝试绘制网络图并仅显示geom_node_text的标签，这些标签的中心分数高于特定阈值。我的代码如下：

rt_tbl %>% 
mutate(centrality = centrality_authority()) %>% 
ggraph(layout = 'kk') + 
geom_edge_link(aes(), colour = "gray", alpha = 0.5) + 
geom_node_point(aes(size = centrality, colour = centrality)) + 
geom_node_text(data=subset(centrality > 0.6), aes(centrality, label=name)) + 
theme_graph(base_family = "Roboto Condensed", base_size = 13)

我遇到以下错误：

Error in subset(centrality > 100) : object 'centrality' not found

我的数据如下：

# A tbl_graph: 1589 nodes and 3992 edges
# A directed multigraph with 3 components
# Node Data: 1,589 x 3 (active)
        name degree centrality
        <chr>  <dbl>      <dbl>
1   Ashinlay1970     35 0.90053429
2     WinTunMin1     25 0.66408597
3 Yaminayeyaohn1      2 0.06080755
4  TUNOO00655880      3 0.07609831
5     inewagency      8 0.21569006
6         KSwe03      4 0.12416238
# ... with 1,583 more rows

# Edge Data: 3,992 x 2
from    to
<int> <int>
1     1    48
2     1    49
3     1     1
# ... with 3,989 more rows

Answer 1

我以前从未使用过ggraph，你应该提供一个可重复的最小例子，但试试这个：

rt_tbl %>% 
    mutate(centrality = centrality_authority()) %>% 
    ggraph(layout = 'kk') + 
    geom_edge_link(aes(), colour = "gray", alpha = 0.5) + 
    geom_node_point(aes(size = centrality, colour = centrality)) + 
    geom_node_text(aes(label=ifelse(centrality > .6, name, NA))) + 
    theme_graph(base_family = "Roboto Condensed", base_size = 13)

您的subset - 方法不起作用，因为它不会查看rt_tbl内部，但会尝试获取不存在的对象centrality。但它无论如何都不会起作用，因为你需要给它一个与数据长度相同的向量，但子集只返回符合你条件的值。因此，使用ifelse更适合您的任务。

编辑：

BTW 这个是一个可重复性最小的例子（至少我现在知道如何使用ggraph）：

library(tidygraph)
library(ggraph)

rt_tble <- tidygraph::create_star(10) %>% 
    mutate(centrality = centrality_authority(), 
           name = LETTERS[1:10])

ggraph(graph = rt_tble) +
    geom_edge_link() +
    geom_node_point(aes(size = centrality, colour = centrality)) + 
    geom_node_text(aes(label = ifelse(centrality > .6, as.character(name), NA_character_)))

我必须使用as.character(name)代替name或levels(name)（就像我之前所做的那样），也许你必须在上面的解决方案中改变它......

但关于这一点，请看下面的@Alper Yilmaz解决方案。

Answer 2

这不是一个答案，而是对使用上述答案的任何未来访客的评论。当我在不同的网络中尝试levels(name)时，它给出了错误的结果。 tidygraph具有filter属性，可用于各种geoms以过滤节点，边缘等。

因此，如果写成：

，上面答案的geom_node_text行应该会更好

geom_node_text(aes(filter=centrality > .6, label = name))

绘制特定geom_node_text的标签

2 个答案:

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