我希望有一些类似于geom_boxplot的东西,但是它只有一个框,我可以设置框的下部和上部的功能,例如,显示加减1 SD平均数据。如果stat_boxplot
可用于此目的,或者某些其他功能更适合,我不是。
这可以(几乎)使用stat =" identity"手动完成数据。和预先计算,例如:
y <- rnorm(100)
y1 <- mean(y) - sd(y)
y2 <- mean(y) + sd(y)
df1 <- data.frame(y)
df2 <- data.frame(
x = 1,
y0 = y1,
y25 = y1,
y50 = y1, # this is a problem...
y75 = y2,
y100 = y2
)
ggplot(df1, aes(x=1,y=y)) +
geom_boxplot() +
geom_boxplot(data = df2,
mapping = aes(x = 1, y = 1, ymin = y0, lower = y25, middle = y50, upper = y75, ymax = y100),
stat = "identity", alpha = 0.1, fill = "red")
这个例子有几个问题:
简而言之,我喜欢像geom_box这样的东西但是无法通过谷歌搜索找到它,我很乐意为某些方向如何继续编写这样的自定义geom函数(我猜this是一个开始,但欢迎一些更多的帮助。)
答案 0 :(得分:1)
newbox <- function(values) {
values <- na.omit(values)
data.frame(
ymin = mean(values) - sd(values),
lower = mean(values) - sd(values),
middle = mean(values),
upper = mean(values) + sd(values),
ymax = mean(values) + sd(values),
width = 0.75
)
}
ggplot(iris, aes(Species, Sepal.Length)) +
stat_summary(fun.data = newbox, geom = "boxplot", fatten = NA)
喜欢那个?
如果你想要它没有填充,你可以使用内置函数,如:
ggplot(iris, aes(Species, Sepal.Length)) +
stat_summary(fun.data = mean_sdl, fun.args = list(mult = 1),
geom = "crossbar", fatten = NA)