Question

我有这样的文件

Ind   M1  M2    M3   M4   M5
P1   AA   -/-    GG   CC   TT
P2   TT    AA  GG   TT    CC
1     TT    GG  CC   AA    GG
2     GG   CC   TT   GG   CC
3     AA    TT   GG  CC   TT
4     CC    GG  TT   AA   CC
5      GG   CC  AA   CC   TT

我想检查P1和P2是否匹配M1，如果它们匹配，那么应该选择该列并写入outfile，这样我想继续剩下的列直到M5。我是R的新手，尝试使用嵌套for循环，但无法得到它。 excel非常简单，但问题是我的数据中有超过44k列。如果R将它们降低到16000以下那么我可以在excel中工作以进行进一步的分析。在这方面有谁可以帮助我？任何帮助将受到高度赞赏提前致谢此致

Answer 1

如果我理解正确你想存储M1的列，如果它们与P1和P2匹配，如果是这种情况，我会这样做：

tmp <- matrix(rep(1,20),nrow = 4, ncol = 5)
tmp <- as.data.frame(tmp)
tmp <- setNames(tmp, letters[1:5])

names_int <- c("a","b", "c")


output <- sapply(names_int, function(x){
if(identical(tmp[[x]], tmp[["d"]]) & identical(tmp[[x]], tmp[["e"]])){
return(tmp[[x]])
}})

其中＆＃34; d＆＃34;和＆＃34; e＆＃34;将是您的P1和P2，names_int是您要匹配的变量的名称

在R中将一行与另一行匹配，并将结果写入另一个文件

1 个答案: