我正在尝试使用图形工具来绘制带有彩色顶点的网络图。我正在尝试从下面显示的here绘制以下graphML文件。
但是,使用以下代码不显示颜色:
g = Graph()
g= load_graph("filename.graphml", fmt="graphml")
graph_draw(g)
图形渲染但顶点上没有颜色,仅用于默认红色。我认为graphML得到了完全支持?
图形工具文档声明:“唯一能够完美保留内部属性映射的文件格式是”gt“和”graphml“。因此,它们应尽可能优先于其他格式。”
颜色不是内部属性吗?
Oringinally我在DOT中绘图。我有一个颜色数组,其索引取决于节点的名称 - 节点是按升序排列的整数。但是,当我使用时:
for v in g.vertices():
v_prop[v] = colourarray[vertex]
颜色与正确的节点不对应。这是因为load_graph似乎对哪个节点是哪个索引有自己的想法。有没有人知道我能在这做什么?
<graphml xmlns="http://graphml.graphdrawing.org/xmlns" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xsi:schemaLocation="http://graphml.graphdrawing.org/xmlns http://graphml.graphdrawing.org/xmlns/1.0/graphml.xsd">
<key id="d0" for="node" attr.name="color" attr.type="string">
<default>yellow</default>
</key>
<key id="d1" for="edge" attr.name="weight" attr.type="double"/>
<graph id="G" edgedefault="undirected">
<node id="n0">
<data key="d0">green</data>
</node>
<node id="n1"/>
<node id="n2">
<data key="d0">blue</data>
</node>
<node id="n3">
<data key="d0">red</data>
</node>
<node id="n4"/>
<node id="n5">
<data key="d0">turquoise</data>
</node>
<edge id="e0" source="n0" target="n2">
<data key="d1">1.0</data>
</edge>
<edge id="e1" source="n0" target="n1">
<data key="d1">1.0</data>
</edge>
<edge id="e2" source="n1" target="n3">
<data key="d1">2.0</data>
</edge>
<edge id="e3" source="n3" target="n2"/>
<edge id="e4" source="n2" target="n4"/>
<edge id="e5" source="n3" target="n5"/>
<edge id="e6" source="n5" target="n4">
<data key="d1">1.1</data>
</edge>
</graph>
</graphml>
答案 0 :(得分:0)
您正在混淆属性贴图的存在与实际用于绘图的属性贴图。如果要使用属性映射,则必须明确地执行此操作:
my_container_7
请查看文档,其中包含许多此类示例。
dot和graphml文件中存在的固有顶点“名称”作为内部属性映射加载。对于dot,属性映射名为“vertex_name”:
graph_draw(g, vertex_fill_color=g.vp.color)
在graphml的情况下,如果顶点标签不是规范的(即从0到N-1编号),则存储为“_graphml_vertex_id”:
g.vp.vertex_name