我有一个脚本循环我的文件,组合两个文件并运行python脚本。但是,如果我运行它,我会收到一个错误:
Syntax error: end of file unexpected (expecting "done")
我的剧本出了什么问题?
#!/bin/sh
for file1 in *R1*fastq
do
file2=${file1/R1/R2}
out=${file1%%.fastq}_output
python spades.py --careful -1 $file1 -2 $file2 -o $out
done