从多列过滤和替换

Question

我有一个文件，我必须用pval > 0.05替换大于0.05（NA）的pvalue，换句话说，保留pval < 0.05并用{替换p val > 0.05 {1}}。

例如：

NA

输出：

Rv_FC    Rv_Pval  Gc_FC  Gc_Pval ......
2          0.001   3      0.99
3          0.99    1      0.0002
3          0.0001  2      0.89

只应考虑pval列，如果它们的值是＆gt; 0.05，应该用Rv_FC Rv_Pval Gc_FC Gc_Pval ...... 2 0.001 3 NA 3 NA 1 0.0002 3 0.0001 2 NA 替换。

优势：pval列位于第3，第5，第7列...列..

Answer 1

这个应该有效：

awk 'BEGIN{ OFS = "\t" }NR==1{ for ( i = 1; i <= NF; i++) if ( $i ~"Pval" ) a[i]; print $0}NR>1{for ( i in a ) if ( $i > 0.5 ) $i = "NA"; print $0 }' file

输出：

Rv_FC    Rv_Pval  Gc_FC  Gc_Pval  
2        0.001     3      NA
3        NA        1      0.0002
3        0.0001    2      NA