Question

当我在scikit-image软件包中使用打开操作时，我收到内存错误（它使我的RAM饱和）。对于3-D结构元素发生该记忆错误，该结构元素是半径为16或更大的球/球。我正在尝试使用粒度来测量图像中对象的大小分布（3D数组），因此我需要构造增加半径的元素。内存需求也呈指数级增长，我无法找到解决方法。是否有一个简单的解决方案来解决这个问题，以便我可以使用更大半径的结构元素？图像尺寸为200X200X200。 TIA

Traceback (most recent call last):
  File "R3.py", line 124, in <module>
    output_image = skimage.morphology.binary_opening(image, ball)
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/skimage/morphology/binary.py", line 117, in binary_opening
    eroded = binary_erosion(image, selem)
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/skimage/morphology/binary.py", line 41, in binary_erosion
    ndimage.convolve(binary, selem, mode='constant', cval=1, output=conv)
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/scipy/ndimage/filters.py", line 696, in convolve
    origin, True)
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/scipy/ndimage/filters.py", line 544, in _correlate_or_convolve
    _nd_image.correlate(input, weights, output, mode, cval, origins)
MemoryError

Answer 1

尺寸200x200x200的体积非常小。粒度测量由连续开口组成，因此您只需要2个体积进行计算：一个临时在侵蚀和膨胀之间，另一个用于最终结果。这意味着共有三卷。结构元素应该是一个坐标列表，所以不要太大。

因此，绝对没有理由不能在计算机上对这样的体积进行粒度测量。指数内存使用的唯一解释是中间结果不会被删除。

使用Sci-Kit Image包中的二进制打开操作进行粒度测量时出现内存错误

1 个答案: