Question

我有i7-5960X CPU，8核+ HT（16线程）。这是一个尝试使用OpenMP和OpenMPI的程序。它呼吁如下：

catch

其中NN1和NN2是变化的。在代码中我有这个：

# mpirun -np <NN1> -x OMP_NUM_THREADS=<NN2> <my_prog>

结果如下：

#pragma omp parallel
    nOMP=omp_get_num_threads();

    int maxOMP=omp_get_max_threads();
    int procOMP=omp_get_num_procs();
    printf("OMP version running on %d threads. Max threads=%d, available procs=%d\n", nOMP, maxOMP, procOMP);

因此，对于1和2 mpi线程，omp_get_num_procs（）返回＆＃34; 2＆＃34;总是和3及以上它返回＆＃34; 16＆＃34;。

问题是：为什么以及如何强制它为1和2 mpi线程返回正确的值？

OpenMpi版本为1.10.3，GCC版本为4.8.5，Centos 7 x86_64。没有mpirun的直接电话也是正确的。

UPD1以下是相关讨论：http://forum.abinit.org/viewtopic.php?f=2&t=2782，但无论如何都没有答案。

UPD2 openmpi-2.x.x解决此问题。

Answer 1

1.10.x版本中的一些错误。 Openmpi-2.x.x解决了这个问题。

Answer 2

默认绑定是 -如果> 2，则class Object[] extends Object implements Cloneable, Serializable { public final int length = /*value from array creation*/; public Object[] clone() { try { return (Object[]) super.clone(); } catch (CloneNotSupportedException e) { throw new InternalError(e.getMessage()); } } } class User[] extends Object[] { public User[] clone() { return (User[]) super.clone(); } }（例如套接字） -NUMA domain否则

因此，如果您core，则每个MPI任务将只有一个核心但是如果您mpirun -np 2 ...，则每个MPI任务都绑定到一个套接字。

例如，在我的VM（1个插槽和4个内核）上

mpirun -np 3 ...

Cpus_allowed_list：0-3

您可以$ mpirun -np 2 grep Cpus_allowed_list /proc/self/status Cpus_allowed_list: 0 Cpus_allowed_list: 1 $ mpirun -np 3 grep Cpus_allowed_list /proc/self/status Cpus_allowed_list: 0-3 Cpus_allowed_list: 0-3甚至是mpirun -bind-to socket来更改默认的绑定选项。

openmpi下openmp中的奇怪任务行为

2 个答案: