我正在尝试为家庭数据实施EM算法,我假设我的观察结果具有多变量t分布。我每个家庭只有两个兄弟姐妹,所以所有的家庭团体只有两个观察。基本上我正在尝试遵循本文中的E(C)M步骤: https://pdfs.semanticscholar.org/9445/ef865c4eb1431f9cb2abdb5efc1c361172cc.pdf
然而,现在我不确定EM是否可以用于这种数据,因为我的相关矩阵Psi应该是家族的块对角线。
所以这是一个关于我的家庭结构如何的R例子
fam_id = sort(rep(1:5, 2))
Z= matrix(0, nrow = length(fam_id), ncol = length(unique(fam_id)))
colnames(Z) = unique(fam_id)
k = 1
i = 1
# Random effects dummy matrix
while (k <= ncol(Z)) {
Z[i:(i+1), k] = c(1, 1)
k = k +1
i = i+2
}
> Z
1 2 3 4 5
[1,] 1 0 0 0 0
[2,] 1 0 0 0 0
[3,] 0 1 0 0 0
[4,] 0 1 0 0 0
...
EM算法在第5次迭代后扼杀,表示相关矩阵Psi不是:
solve.default(psi_hat)出错: 系统是计算奇异的
如果有人能对此有所了解,我会非常高兴!
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您可能在第5次迭代中以不可逆矩阵结束