Question

我在Docker上安装rstudio服务器。当我想安装包png时，我收到了错误的消息

`* installing *source* package ‘png’ ...
** package ‘png’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** libs
gcc -std=gnu99 -I/usr/local/lib/R/include -DNDEBUG  -I/usr/local/include    
`libpng-config --cflags` -fpic  -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -
Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c read.c -o 
read.o
/bin/bash: libpng-config: command not found
read.c:3:17: fatal error: png.h: No such file or directory
#include <png.h>
             ^
compilation terminated.
/usr/local/lib/R/etc/Makeconf:132: recipe for target 'read.o' failed
make: *** [read.o] Error 1
ERROR: compilation failed for package ‘png’
* removing ‘/usr/local/lib/R/site-library/png’
Warning in install.packages :
installation of package ‘png’ had non-zero exit status`

我想也许我应该安装一个名为libpng-devel的库，但如何在docker下安装它？请你告诉我？如果它是ubuntu或centos我知道apt-get或yum，但在码头下，我很困惑。

Answer 1

您需要标识Rstudio的运行容器（例如docker ps），然后使用docker exec -it <container-id>在该容器中启动bash shell。从外壳程序，您可以安装所需的任何系统软件包。

来源：https://github.com/rocker-org/rocker/wiki/Using-the-RStudio-image#dependencies-external-to-the-r-system

Answer 2

添加到上面的prusswan的答案中。使用Windows命令在命令行上首先找到您的容器名称：

docker -ps

这将为您提供图像ID和名称（如果有）。我将使用id打开bash命令行界面：

docker exec -ti d352815fb16b bash

现在，我们将安装所需的png所需的linux库。在bash shell中，输入：

apt-get install libpng-dev

您应该收到确认提示，键入y，它将安装。要退出linux shell，请键入Cntl-D。

现在返回浏览器中的Rocker界面，并尝试再次安装png：

install.packages('png')

在Docker上的Rstudio上安装包png，但失败了

2 个答案: