在R

时间:2017-03-27 13:25:41

标签: r xml special-characters hyphenation xml2

我正在使用R中的xml2包来解析我的xml文件。一切都很完美,除了这一个标签,标签名称中有一个破折号。

XML示例:

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<abstracts-retrieval-response xmlns="http://www.elsevier.com/xml/svapi/abstract/dtd" xmlns:ait="http://www.elsevier.com/xml/ani/ait" xmlns:ce="http://www.elsevier.com/xml/ani/common" xmlns:cto="http://www.elsevier.com/xml/cto/dtd" xmlns:dc="http://purl.org/dc/elements/1.1/" xmlns:prism="http://prismstandard.org/namespaces/basic/2.0/" xmlns:xocs="http://www.elsevier.com/xml/xocs/dtd" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance">
  <coredata>
    <prism:url>http://api.elsevier.com/content/abstract/scopus_id/85011891272</prism:url>
    <dc:identifier>SCOPUS_ID:85011891272</dc:identifier>
    <eid>2-s2.0-85011891272</eid>
    <prism:doi>10.1186/s13638-017-0812-8</prism:doi>
    <article-number>29</article-number>
    <dc:title>Performance of emerging multi-carrier waveforms for 5G asynchronous communications</dc:title>
    <prism:aggregationType>Journal</prism:aggregationType>
    <srctype>j</srctype>
    <citedby-count>0</citedby-count>
    <prism:publicationName>Eurasip Journal on Wireless Communications and Networking</prism:publicationName>
    <dc:publisher> Springer International Publishing </dc:publisher>
    <source-id>18202</source-id>
    <prism:issn>16871499</prism:issn>
    <prism:volume>2017</prism:volume>
    <prism:issueIdentifier>1</prism:issueIdentifier>
    <prism:coverDate>2017-12-01</prism:coverDate>
 </coredata>
</abstracts-retrieval-response>

我正在使用这行代码来提取prism:doi节点内的文本(按预期工作):

xml2::xml_text(xml2::xml_find_first(intermediateXML,"//prism:doi"))

提取“引用计数”值的相同代码会返回“NA”而不是实际值。

xml2::xml_text(xml2::xml_find_first(intermediateXML,"//citedby-count"))

我的猜测是,解析器与标签内的“ - ”混淆。有没有避免这个问题?

3 个答案:

答案 0 :(得分:0)

您是否尝试更新xml2?在我的Mac上使用xml2版本1.1.1它可以工作:

doc <- read_xml(txt) %>% 
  xml_find_first("/coredata")

doc %>% xml_find_first("citedby-count") %>% xml_text # "0"
doc %>% xml_find_first("//citedby-count") %>% xml_text # "0"

如果这不起作用,您可以尝试将NS指定为

doc %>% xml_find_first("citedby-count", ns = character()) %>% xml_text

数据和包

require(xml2)
require(magrittr)
txt <- '<coredata>
    <prism:url>http://api.elsevier.com/content/abstract/scopus_id/85011891272</prism:url>
<dc:identifier>SCOPUS_ID:85011891272</dc:identifier>
<eid>2-s2.0-85011891272</eid>
<prism:doi>10.1186/s13638-017-0812-8</prism:doi>
<article-number>29</article-number>
<dc:title>Performance of emerging multi-carrier waveforms for 5G asynchronous communications</dc:title>
<prism:aggregationType>Journal</prism:aggregationType>
<srctype>j</srctype>
<citedby-count>0</citedby-count>
<prism:publicationName>Eurasip Journal on Wireless Communications and Networking</prism:publicationName>
<dc:publisher> Springer International Publishing </dc:publisher>
<source-id>18202</source-id>
<prism:issn>16871499</prism:issn>
<prism:volume>2017</prism:volume>
<prism:issueIdentifier>1</prism:issueIdentifier>
<prism:coverDate>2017-12-01</prism:coverDate></coredata>'

答案 1 :(得分:0)

我无法按照我的意图解决问题。最后,我通过使用xml2 :: as_list函数并通过

选择元素来解决问题
intermediateXML <- xml2::read_xml(serverResponse)
listXML <- xml2::as_list(intermediateXML)

listXML$coredata$`citedby-count`[[1]]

非常感谢@ Floo0

答案 2 :(得分:0)

在这个场景到达很晚。以下是我发现的可能对其他人有帮助的解决方案:

doc %>% xml_find_all( "//*[name()='my-dash-tag']" )