在网络上,我发现 rbind()
用于组合两个数据框,同一任务由 bind_rows()
功能执行。
然后我不明白这两个函数之间有什么区别,哪个更有效?
答案 0 :(得分:23)
除了更多的差异之外,使用bind_rows
超过rbind
的主要原因之一是组合具有不同列数的两个数据帧。在这种情况下,rbind
会引发错误,而bind_rows
会指定" NA
"到数据帧中没有提供值的数据帧中缺少的那些行列。
尝试使用以下代码来查看差异:
a <- data.frame(a = 1:2, b = 3:4, c = 5:6)
b <- data.frame(a = 7:8, b = 2:3, c = 3:4, d = 8:9)
两个电话的结果如下:
rbind(a, b)
> rbind(a, b)
Error in rbind(deparse.level, ...) :
numbers of columns of arguments do not match
library(dplyr)
bind_rows(a, b)
> bind_rows(a, b)
a b c d
1 1 3 5 NA
2 2 4 6 NA
3 7 2 3 8
4 8 3 4 9
答案 1 :(得分:1)
虽然bind_rows()
在将合并具有不同列数的数据帧(将NA
分配给缺少这些列的行的意义上)更有用,但是如果您要合并具有相同列的数据帧列,我建议使用rbind()
。
rbind()
计算效率更高,并且当列数不同时,它只会引发错误。大数据集将为您节省大量时间。对于这些情况,我强烈建议rbind()
。但是,如果数据具有不同的列,则必须使用bind_rows()
。
答案 2 :(得分:1)
由于此处没有答案可以对base::rbind
和dplyr::bind_rows
之间的差异进行系统的回顾,并且kss关于性能的答案不正确,因此我决定添加以下内容。
我们有一些测试数据框架:
df_1 = data.frame(
v1_dbl = 1:1000,
v2_lst = I(as.list(1:1000)),
v3_fct = factor(sample(letters[1:10], 1000, replace = TRUE)),
v4_raw = raw(1000),
v5_dtm = as.POSIXct(paste0("2019-12-0", sample(1:9, 1000, replace = TRUE)))
)
df_1$v2_lst = unclass(df_1$v2_lst) #remove the AsIs class introduced by `I()`
base::rbind
以不同方式处理列表输入rbind(list(df_1, df_1))
[,1] [,2]
[1,] List,5 List,5
# You have to combine it with `do.call()` to achieve the same result:
head(do.call(rbind, list(df_1, df_1)), 3)
v1_dbl v2_lst v3_fct v4_raw v5_dtm
1 1 1 b 00 2019-12-02
2 2 2 h 00 2019-12-08
3 3 3 c 00 2019-12-09
head(dplyr::bind_rows(list(df_1, df_1)), 3)
v1_dbl v2_lst v3_fct v4_raw v5_dtm
1 1 1 b 00 2019-12-02
2 2 2 h 00 2019-12-08
3 3 3 c 00 2019-12-09
base::rbind
可以应付(某些)混合类型 base::rbind
和dplyr::bind_rows
都在尝试绑定时失败,例如将原始列或日期时间列更改为其他类型的列,base::rbind
可以解决一定程度的差异。
将列表和非列表列组合会产生一个列表列。将一个因素与其他因素结合会产生警告,但不会产生错误:
df_2 = data.frame(
v1_dbl = 1,
v2_lst = 1,
v3_fct = 1,
v4_raw = raw(1),
v5_dtm = as.POSIXct("2019-12-01")
)
head(rbind(df_1, df_2), 3)
v1_dbl v2_lst v3_fct v4_raw v5_dtm
1 1 1 b 00 2019-12-02
2 2 2 h 00 2019-12-08
3 3 3 c 00 2019-12-09
Warning message:
In `[<-.factor`(`*tmp*`, ri, value = 1) : invalid factor level, NA generated
# Fails on the lst, num combination:
head(dplyr::bind_rows(df_1, df_2), 3)
Error: Column `v2_lst` can't be converted from list to numeric
# Fails on the fct, num combination:
head(dplyr::bind_rows(df_1[-2], df_2), 3)
Error: Column `v3_fct` can't be converted from factor to numeric
base::rbind
保留行名Tidyverse提倡将行名放入专用列中,因此其功能将其删除。
rbind(mtcars[1:2, 1:4], mtcars[3:4, 1:4])
mpg cyl disp hp
Mazda RX4 21.0 6 160 110
Mazda RX4 Wag 21.0 6 160 110
Datsun 710 22.8 4 108 93
Hornet 4 Drive 21.4 6 258 110
dplyr::bind_rows(mtcars[1:2, 1:4], mtcars[3:4, 1:4])
mpg cyl disp hp
1 21.0 6 160 110
2 21.0 6 160 110
3 22.8 4 108 93
4 21.4 6 258 110
base::rbind
无法解决缺少的列仅出于完整性考虑,因为Abhilash Kandwal已在回答中如此表示。
base::rbind
以不同方式处理命名参数虽然base::rbind
在行名前加上参数名,但是dplyr::rbind
可以选择添加专用ID列:
rbind(hi = mtcars[1:2, 1:4], bye = mtcars[3:4, 1:4])
mpg cyl disp hp
hi.Mazda RX4 21.0 6 160 110
hi.Mazda RX4 Wag 21.0 6 160 110
bye.Datsun 710 22.8 4 108 93
bye.Hornet 4 Drive 21.4 6 258 110
dplyr::bind_rows(hi = mtcars[1:2, 1:4], bye = mtcars[3:4, 1:4], .id = "my_id")
my_id mpg cyl disp hp
1 hi 21.0 6 160 110
2 hi 21.0 6 160 110
3 bye 22.8 4 108 93
4 bye 21.4 6 258 110
base::rbind
将向量参数分成行(并回收它们)相反,dplyr::bind_rows
添加列(因此需要命名x的元素):
rbind(mtcars[1:2, 1:4], x = 1:2))
mpg cyl disp hp
Mazda RX4 21 6 160 110
Mazda RX4 Wag 21 6 160 110
x 1 2 1 2
dplyr::bind_rows(mtcars[1:2, 1:4], x = c(a = 1, b = 2))
mpg cyl disp hp a b
1 21 6 160 110 NA NA
2 21 6 160 110 NA NA
3 NA NA NA NA 1 2
base::rbind
较慢,需要更多RAM 要绑定一百个中等大小的数据帧(一千行),base::rbind
需要多出50倍的RAM,并且要慢15倍以上:
dfs = rep(list(df_1), 100)
bench::mark(
"base::rbind" = do.call(rbind, dfs),
"dplyr::bind_rows" = dplyr::bind_rows(dfs)
)[, 1:5]
# A tibble: 2 x 5
expression min median `itr/sec` mem_alloc
<bch:expr> <bch:tm> <bch:tm> <dbl> <bch:byt>
1 base::rbind 47.23ms 48.05ms 20.0 104.48MB
2 dplyr::bind_rows 3.69ms 3.75ms 261. 2.39MB
由于我需要绑定许多小数据帧,因此这也是一个基准。两者的速度,尤其是RAM的差异非常惊人:
dfs = rep(list(df_1[1:2, ]), 10^4)
bench::mark(
"base::rbind" = do.call(rbind, dfs),
"dplyr::bind_rows" = dplyr::bind_rows(dfs)
)[, 1:5]
# A tibble: 2 x 5
expression min median `itr/sec` mem_alloc
<bch:expr> <bch:tm> <bch:tm> <dbl> <bch:byt>
1 base::rbind 1.65s 1.65s 0.605 1.56GB
2 dplyr::bind_rows 19.31ms 20.21ms 43.7 566.69KB
最后,help("rbind")
和help("bind_rows")
也很有趣。