如何在终端上的文件中使用grep -f检测某些模式，并在没有模式

Question

我在mac终端上。 我有一个txt文件，其中一列有9个ID，allofthem.txt，其中每个ID都以¨rs¨开头：

rs382216
rs11168036
rs9296559
rs9349407
rs10948363
rs9271192
rs11771145
rs11767557
rs11

另外，我有另一个txt文件，useful.txt，以及那些在我做过的分析中有用的ID。它看起来是一样的，一列有几行ID，但IDS较少，只有5.

rs9349407
rs10948363
rs9271192
rs11

问题：我想生成一个新的txt文件，其中包含无效的文件（出现在allofthem.txt中但不在有用的.txt中）。

我想反过来：

grep -f useful.txt allofthem.txt 

我想使用一些系统的方法删除有用的所有ID，并获取剩余的ID。也许用awk或sed，但我看不到它。你能帮我吗？提前谢谢！

期望的输出：

rs382216
rs11168036
rs9296559
rs11771145
rs11767557

Answer 1

-v选项为您做反过来：

grep -vxf useful.txt allofthem.txt > remaining.txt

-x选项匹配allofthem.txt中的整行，而不是部分。

正如@ hek2mgl正确指出的那样，如果你想将useful.txt的内容视为字符串而不是模式，则需要-F：

grep -vxFf useful.txt allofthem.txt > remaining.txt

确保您的文件没有前导或尾随空格 - 它们可能会影响结果。

Answer 2

我建议使用awk：

awk 'FNR==NR{patterns[$0];next} $0 in patterns' useful.txt allofthem.txt

说明：

只要我们正在阅读FNR==NR，

useful.txt就是真的。我们为patterns的每一行useful.txt创建一个索引。 next停止进一步处理。

由于上一个$0 in patterns语句，

next在allofthem.txt的每一行上运行。如果它是patterns中的密钥，它会检查该文件的每一行。如果检查结果为true awk，则会打印该行。