knitr无法打印出system2（）输出

Question

在R控制台中，我可以通过以下方式看到system2（）的输出：

> STAR<-'/opt/NGS/STAR/STAR-2.5.2b/bin/Linux_x86_64_static/STAR'
>     system2(STAR,'--version')
STAR_2.5.2b

但是当我在.Rnw文件中有一个块时，就像那样：

\begin{frame}[fragile]{Global STAR settings}
<<echo=TRUE, results="asis">>=
STAR<-'/opt/NGS/STAR/STAR-2.5.2b/bin/Linux_x86_64_static/STAR'
system2(STAR,'--version')
@   
\end{frame}

应该在页面上打印出STAR_2.5.2b但没有打印出来。有人知道为什么吗？

Answer 1

尝试设置stdout = TRUE，即system2(STAR,'--version', stdout = TRUE)。